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xiewen83

木虫 (小有名气)

带着眼镜的“农民”

[交流] 【求助/交流】何为BAC pooling strategy?

今天看到一篇概述,其中提到“构建10×基因组覆盖度的BAC文库;还有BAC pooling”,我的问题是:在构建BAC文库时,怎么控制这个BAC文库的基因组覆盖度?还有就是BAC pooling具体是什么意思?请哪位高手详细解释下,谢谢。
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Venson
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浅歌99

新虫 (初入文坛)

刚才漏了,不好意思

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  • 附件 1 : 大白菜BAC文库的构建及相关基因的筛选分析.kdh.lnk
  • 2013-07-15 17:22:27, 567 bytes
3楼2013-07-15 17:22:58
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浅歌99

新虫 (初入文坛)


xiewen83(金币+1): 谢谢参与
我是实验新手,看过有关的文献,BAC pooling是构建超级池。也就是将建成的文库池化,然后PCR筛选。后面这篇论文对超级池写的比较详细,希望能对你有所帮助。
2楼2013-07-15 17:21:55
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文库构建

铁虫 (小有名气)



xiewen83(金币+1): 谢谢参与
构建BAC文库一般要求覆盖7-10倍基因组,库容量越大覆盖倍数越高。假如您构建的物种基因组大小约500mb,按百博明创(北京)公司所建文库插入片段的平均大小在100kb计算,覆盖基因组7倍,库容量将达到约3.5万个clone;覆盖10倍,库容量达到约5万个clone。
    构建BAC文库是一件非常复杂工作量的工作,大型BAC文库筛选更是一件庞大的工程,他们可以免费为客户提供相关技术信息,帮您建立BAC文库筛选系统。同时可以根据客户需要提供构建好的 pool 和 superpool,帮助客户建立“2维”、“3维”、最多达到“5维”的快速筛选系统。
pool就是池(每块384孔板的一个混合池)


来源新浪博客:http://blog.sina.com.cn/s/blog_e4e0c7460101de4o.html
4楼2013-10-31 09:33:34
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