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xiaowu787

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】高温高压的体系需要注意的环节已有4人参与

希望LAMMPS模拟的模型中心产生一个高温高压(有时间寿命)的局部区,然后观测温度和压力的向周围扩展的情况。可是温度高压强高时会出现lost atoms,现在

第一个疑问是:周期边界条件下的image atom怎么不起作用了--周期性的边界条件不是可以保证粒子数不变?
第二: 局部升温的选择:
1. fix all nve+fix 局部 temp/rescale,可是压强无法控制
2. fix all nve+fix 局部 nvt or npt? 符合实际情况吗?
3. fix all npt+fix 局部 nvt or npt? 符合实际情况吗?
4. fix all nvt+fix 局部 nvt or npt? 符合实际情况吗?
那种选择更好一些?
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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-09-29 19:13:01
你不说你做的是什么东西,什么过程,这问题没法说。
2楼2010-09-29 18:02:49
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

★ ★
zh1987hs(金币+2):鼓励交流 2010-09-29 20:44:05
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-09-29 18:02:49:
你不说你做的是什么东西,什么过程,这问题没法说。

就是做一个合金体系:模型如图


从模型中心开始选一段加热,至中间加热部分全部熔化,希望加热区域即保持一段时间的高温又保持较高的压强

[ Last edited by xiaowu787 on 2010-9-29 at 20:40 ]
3楼2010-09-29 20:37:00
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manutdhk

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+4):谢谢 2010-09-29 22:31:27
引用回帖:
Originally posted by xiaowu787 at 2010-09-29 13:22:26:
希望LAMMPS模拟的模型中心产生一个高温高压(有时间寿命)的局部区,然后观测温度和压力的向周围扩展的情况。可是温度高压强高时会出现lost atoms,现在

第一个疑问是:周期边界条件下的image atom怎么不起作用 ...

记得先前有位版友也提到过 高温的时候 lost atoms。
我不是用lammps的,所以具体不清楚什么原因。但是据经验分析,lost atoms,是不是因为粒子速度过大,在步长之内的位移过大,以至于越出了边界?
温度的扩散容易模拟和控制,但是压强的扩散就麻烦一点了。一般来说,压强可以通过外加应力,或者改变晶格参数来实现。如果不是恒压,应该选取NPT的系综,而且体积大小、形状都允许发生变化。
建议,先做温度扩散,再做压力扩散,然后再综合考虑。
4楼2010-09-29 21:08:59
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-09-29 22:42:09
引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2010-09-29 21:08:59:


记得先前有位版友也提到过 高温的时候 lost atoms。
我不是用lammps的,所以具体不清楚什么原因。但是据经验分析,lost atoms,是不是因为粒子速度过大,在步长之内的位移过大,以至于越出了边界?
温度的扩 ...

模拟的是一个非平衡过程。可能是粒子的速度过大。但是现在需要的就是温度在短时间内标度到一个较高温度,不是缓慢升温的那种。也就相当于在短时间内给粒子一个较大的速度,也希望最好保持一个较高的压强,这是我想要的条件--有点极端条件。在这样的条件下可能就容易lost atom吧。

[ Last edited by xiaowu787 on 2010-9-29 at 21:17 ]
5楼2010-09-29 21:15:44
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manutdhk

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
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lei0736(金币+4):谢谢 2010-09-29 22:31:59
引用回帖:
Originally posted by xiaowu787 at 2010-09-29 21:15:44:


模拟的是一个非平衡过程。可能是粒子的速度过大。但是现在需要的就是温度在短时间内标度到一个较高温度,不是缓慢升温的那种。也就相当于在短时间内给粒子一个较大的速度,也希望最好保持一个较高的压强,这是 ...

首先应该搞清楚 什么是lost atom?是atom离开了simulation box吗?如果是这样的话,我的意思是,要将时间步长改小,小到让atom可以留在box里。
你在初始化的时候,就可以将特定区域的粒子的动能设为该温度下的动能,就可以啦。
对于压强,要视乎你的simulation的条件来选取实现条件,晶格 or 应力。
6楼2010-09-29 21:33:56
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manutdhk

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3):谢谢 2010-09-29 22:32:21
lei0736(金币+1):欢迎常来 这里做级联碰撞的高人不多 呵呵 2010-09-29 22:33:07
引用回帖:
Originally posted by xiaowu787 at 2010-09-29 21:15:44:


模拟的是一个非平衡过程。可能是粒子的速度过大。但是现在需要的就是温度在短时间内标度到一个较高温度,不是缓慢升温的那种。也就相当于在短时间内给粒子一个较大的速度,也希望最好保持一个较高的压强,这是 ...

cascade的simulation就是将一个粒子的动能设到1MeV这个级别,然后将其放入box里,然后观察box里的原子运动的情况的啦。。可以参考一下。。
7楼2010-09-29 21:35:40
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2010-09-29 21:35:40:


cascade的simulation就是将一个粒子的动能设到1MeV这个级别,然后将其放入box里,然后观察box里的原子运动的情况的啦。。可以参考一下。。

现在是没弄明白,在文献上看到的初始温度(和我设定的温度差不多),压强很大都可以正常进行。现在还搞不清楚内在的原因。
8楼2010-09-29 22:28:35
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manutdhk

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-09-30 08:07:35
引用回帖:
Originally posted by xiaowu787 at 2010-09-29 22:28:35:

现在是没弄明白,在文献上看到的初始温度(和我设定的温度差不多),压强很大都可以正常进行。现在还搞不清楚内在的原因。

能不能做一个简单的测试。首先,将步数变小,譬如 10^-18 sec,把box的粒子数变少一点,4*4*4,然后设定初始速度,让系统自由地跑一段时间,观察一下粒子的轨迹。
9楼2010-09-29 23:07:27
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+4):谢谢,鼓励交流 2010-10-01 15:44:50
引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2010-09-29 23:07:27:


能不能做一个简单的测试。首先,将步数变小,譬如 10^-18 sec,把box的粒子数变少一点,4*4*4,然后设定初始速度,让系统自由地跑一段时间,观察一下粒子的轨迹。

时间步长设置 0.01fs 300K初始弛豫,时间步长改为 1fs 后开始升温2000K(整体NVE+部分temp/rescale(速度标度))也可以进行。但是有个问题--由于整体NVE,导致在部分进行速度标度是,温度向周围传递的很快(形成连续的温度梯度),希望的温度梯度最好不是很连续--中间快速升温时,两端温度上升的越慢越好,当随着时间的推移,温度真正传递到这里时才出现真正的升温过程。

[ Last edited by xiaowu787 on 2010-9-30 at 09:54 ]
10楼2010-09-30 09:51:16
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