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duanjunhyq

金虫 (著名写手)

[交流] 化学画图软件,生成sdf格式

求一款化学画图软件,要求画出来的结构式保存结果为sdf文件,我是用这sdf文件导入到另一个库里面去.

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biotech7

金虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
duanjunhyq(金币+20):非常感谢你的指导
chemdraw和isis都可以搞定啊。很简单的。
2楼2006-05-11 11:38:01
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cakekac

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
steincat(金币+3):多谢参与!~
ChemDraw软件是目前国内外最流行、最受欢迎的化学绘图软件。它是美国CambridgeSoft(www.cambridgesoft.com)公司开发的ChemOffice系列软件中最重要的一员。由于它内嵌了许多国际权威期刊的文件格式,近几年来成为了化学界出版物、稿件、报告、CAI软件等领域绘制结构图的标准。
  Chemdraw软件功能十分强大。可编辑、绘制与化学有关的一切图形,例如,建立和编辑各类分子式、方程式、结构式、立体图形、对称图形、轨道等,并能对图形进行编辑、翻转、旋转、缩放、存储、复制、粘贴等等多种操作。用它绘制的图形可以直接复制粘贴到word软件中使用。最新版本的软件还可以生成分子模型、建立和管理化学信息库、增加了光谱化学工具等功能。
  对于中学化学教师来说,这么多的功能肯定不会都用上。最常用的还是一些基本的绘制功能。本文就这些最基本的功能结合多年的使用经验谈谈运用上的一些技巧,希望同行们在使用该软件时能提高工作效率。

1、  使用环工具技巧
在工具栏中,ChemDraw软件集成了10种环工具,可以对不同种类、不同尺寸的环进行绘制。
1.1 运用Ctrl键可以把环工具绘制成不定域共轭环形式
  首先在工具板上选择一个环工具,然后按下Ctrl键,在文件窗口按动,一个不定域共轭圈就出现在环中间。
       

2.2  Shift键对环戊二烯环和苯环中的双键方向的改变
按住shift,再在文件窗口按图中箭头方向拖动就可以转变双键的方向。

2、  多选的取消技巧
ChemDraw的选择工具有“蓬罩”和“套索”两种,相信大家都会用。但有时候即使是“套索”工具也不能非常准确的刚好选择结构部分,一般地说,有时候会选多。例如,把正方体拉长为长方体,首先要选择前面的正方形的四边和四角点,然后向前按动即可拉长为长方体。但是,在用“套索”工具选择前面正方体的四边和四角点时,往往会把左面正方形的底边和后角点也选中,结果拉长的图形如图3,所以在拉长前必须取消被选的底边和后角点。按住shift键并在底边和后角点单击,这两个部分即被取消被选。

3、定位快捷标记原子
 当我们绘制一个结构图时,在适当的地方要标记出原子时,可用“键”工具将光标放在原子点处定位,此时出现选择块,按c键,标记就被添加到定位的原子处了。这个例子标记的是C原子,适当数目的氢会自动出现。
                 
                    

4、Alt键技巧
  在图形工具面板上选择任意一个图形结构,按住Alt在文件窗口拖动鼠标,则这个图形会随鼠标前后运动而缩小或放大,随鼠标旋转而相应旋转。如果是“键头”工具,则可以任意改变箭头的方向(不用Alt键时,箭头每次只能固定改变15°角)。

5、模板功能
 ChemDraw的“模板”工具中放置着许多类型的模板图形。当需要这类图形时,可以直接到模板库中去取,非常方便。另外,ChemDraw还允许用户自己建立模板库,将平时用得比较多得结构添加到自定义得模板中。这项功能使ChemDraw如虎添翼。下面简单介绍模板功能。
 5.1 建立模板窗口
建立一个新的模板文件的方法:在File菜单中,选Open Special,再选New Templates,此时出现一个新的模板窗口。
 5.2 绘制模板图形
在绘制区绘制一个结构,此结构会出现在第一个模板格内,这样就建立了一个模板图形。依次可以建立15个模板,组成一个模板文件(模板库)。

 5.3 保存模板文件
   从File菜单中,选择Save as ,出现“另存为”对话框,输入模板文件的文件名(中英文均可),保存为ctp文件,单击“确定”按钮。
 重新启动ChemDraw软件时就可以调用自己建立的模板了。
说明:定义的模板图形不止限于由原子和键构成的图形结构,也可以包含任何ChemDraw物体,例如:说明文本、方框、圆弧、轨道、箭头、反应机理符号和曲线等等,模板中的物体还可以着色,还允许从别的文档粘贴图片到模板中。用好模板对我们平时的工作可起到事半功倍的效果。

6、由物质的英文名转换成结构式
 在ChemDraw中,按下shift+Ctrl+n 组合键就可以调出“Insert Structure”对话框,输入英文名称,单击“OK”,此物质的结构就出现在文件窗口了,可以任意编辑。
 这一功能在一定程度上可以代替物质英文名称的翻译,并且同时给出了结构,很方便。

ChemDraw

     ChemDraw是一个化学绘图程序,包括立体化学结构的识别和显示,创建多页文档,ChemNMR 可显示化合物的核磁光谱,并进行校对。 Name=Struct能快速将名称转化为相应的结构, AutoNom 可为指定结构创建IUPAC名称。ChemDraw还可以和 Excel 对接,用互联网连接到 ChemACX.Com ,很容易得到相关的原始资料,ChemDraw 插接件可加入化学智能到你的浏览器,以便从Web 网站查询或显示数据。
     ChemDraw 有三个版本,标准版、专业版和超级版,并提供使用版。
程序开发商:美国剑桥软件公司                       运行平台: Windows: 95, 98, Me, NT, 2000, XP
公司主页:http://www.cambridgesoft.com                     试用版下载
 
   
ChemDraw Ultra 特点
从名称创建结构,从结构创建名称。
预示 1H & 13C 核磁光谱。
基于IUPAC 标准的聚合物命名。
输出结果到 Excel。

 
ChemDraw Pro 特点
通过指定原子和化学键性质,反应中心和结构等,准确查询数据库。
兼容 ISIS 文件,支持 Macintosh/Windows 平台。
可自动整理结构,修改绘制缺陷。
可从 SPC 和 JCAMP 文件显示光谱。
化学智能包括价态、键数和原子个数。
居善地,心善渊,与善仁,言善信,政善治,事善能,动善时,夫唯不争,故无尤。
3楼2006-05-11 12:56:27
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