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guolianshun

金虫 (著名写手)

[交流] 【分享】如何构建缺陷晶体结构和在 ms中如何做空穴 已有8人参与

如何构建缺陷晶体结构
晶体结构改成P1,然后去掉想抹去的原子就可以了
在 ms中如何做空穴
对于金属缺陷,是直接剪切一个原子?
个人经验:就是直接把原子去掉就OK;如果不是正版软件,有可能出现同时去掉其他同位置的原子,如果这种情况,就重新定义,问题就不会出现了.还有,一般考虑孔穴的时候,都要标明哪些原子的迟豫,具体为什么不知道,国外的文献有提到。
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qq364085265

金虫 (著名写手)

小弟正在用MS做超高分子量聚乙烯的热解过程(看了篇文献,说聚乙烯的热分解温度为335-450度,也不知道对不,于是自己设置400度模拟),需要得出其在高温下的断链过程,但是现在出现了以下四个问题:
1、经本人测试,可以处理断键的模块只有三个:CASTEP、Dmol、GULP。请问这个结论对么?
2、聚乙烯中C-H和C-C键的共价半径公差应该设为多少?我目前设置为0.8-1.115(折算成原子距离后C-H键大概在1.272埃断裂,C-C键大概在1.72埃断)。
3、由于聚乙烯没有特殊的基团,聚合度太低会体现出烷烃的性质(例如10个聚合度的聚乙烯就相当于癸烷),因此需要建立较大的聚合度,并且放几根链到一个无定型晶包中,但体系过大用Dmol跑动力学的时候出现了这样的错误:baspar can only handle 0 4、用这三个模块对小体系的聚乙烯跑动力学的时候(400度),过程中都出现过断键的情况,但是接下来跑几步又连上了,这是由于MS软件是根据原子间距离判断是否成键的,请问出现这种情况如何解决?:
真诚迫切需要大神指教!!!!hand:
13楼2012-12-21 17:03:39
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guolianshun

金虫 (著名写手)

补充一下如果是具有对称性原子的单胞建成超胞再找空位怎么操作:第一步在单胞上在build下的symtrey,make P1,第二步:make supper cell。然后挖掉原子。
2楼2010-09-26 10:30:00
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astrolia

禁虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
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3楼2010-09-26 11:12:45
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guolianshun

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by astrolia at 2010-09-26 11:12:45:

一定要手动改成p1么?我挖掉原子之后,看模型,空间群就是P1啊?

不是,是就不需要改了呢。自己的理解,应该是这样。
4楼2010-09-26 11:34:24
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