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icemantoby

木虫 (初入文坛)

[交流] 【讨论】GCMC系综中化学势如何确定 已有6人参与

向大家请教一下:
我用GCMC系综模拟水物体表面的吸附情况,也就是UVT系综,那么体系的化学势是通过什么方法确定的。
我目前了解了几种方法:
第一种方法: 随意假定一个化学势,进行GCMC的模拟,就可以得到体系的压强,同样地得到了水分子的个数,假定一系列的化学势做一些列的模拟,得到压强和水分子个数,做吸附等温线。
存在的疑问:由于是液态水,假定化学势后计算得到的压强是非常大的,有几千甚至上万个bar,所以不知道这种方法是不是可靠,而且也无法得到特定压强下的水分子个数。

第二种方法:听说有这样的公式,可以通过知道压强,而计算得到水或整个体系的化学势,如果这样的话就能得到特定压强下的水分子个数。
存在的疑问:是不是存在这样一个公式?是什么样子的?

第三种方法:在文献中看到有Widom方法来计算化学势。
存在的疑问:我对Widom本身不太了解,另外我用的是MCCCS Towhee来做MC的,这个软件里面基本没有介绍Widom方法的使用,而且好像也没有相关参数的设置。

一般你们都用哪种方法来确定体系的化学势?上述三种方法是不是都可行,还有没有其他的方法可以确定体系的化学势,最好是针对水的。
Thank you in advance!
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ghcacj

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zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-09-23 18:59:50
引用回帖:
Originally posted by icemantoby at 2010-09-23 09:28:54:



你是指固定的分子数码? 也就是先跑NVT系综的MC,此时能得到体系的化学势,然后再将这个化学势作为输入量跑UVT系综的MC。可是第一步的分子数的值怎么确定?因为这个值必定跟体系的压强有关。

具体呢,我也不是很清楚,我也没操作过,不过有篇文献是用towhee做的,你看看它吧。
Greathouse, J. A.; Kinnibrugh, T. L.; Allendorf, M. D. Industrial & Engineering Chemistry Research 2009, 48, 3425.
6楼2010-09-23 18:36:19
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zyj8119

木虫 (著名写手)

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lei0736(金币+1):谢谢 2010-09-22 17:16:34
towhee是先用一个空盒子跑得到化学势的吧,然后再把这个空盒子中放入粒子。。。
好好学习,天天向上。
2楼2010-09-22 16:52:06
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ghcacj

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阿超

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zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-09-22 22:33:31
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-09-22 16:52:06:
towhee是先用一个空盒子跑得到化学势的吧,然后再把这个空盒子中放入粒子。。。

不是这样的,我记得是先将固定的分子放入一个空盒里,跑MC,会计算出一个单位为K的化学势,这个就是第二步计算吸附时的化学势输入量(此时已经将吸附剂加入盒子)。
3楼2010-09-22 19:16:23
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zyj8119

木虫 (著名写手)


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引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-09-22 19:16:23:

不是这样的,我记得是先将固定的分子放入一个空盒里,跑MC,会计算出一个单位为K的化学势,这个就是第二步计算吸附时的化学势输入量(此时已经将吸附剂加入盒子)。

,搞错了!!!!
好好学习,天天向上。
4楼2010-09-22 19:22:57
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icemantoby

木虫 (初入文坛)


zh1987hs(金币+1):谢谢参与讨论 2010-09-23 19:00:03
引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-09-22 19:16:23:

不是这样的,我记得是先将固定的分子放入一个空盒里,跑MC,会计算出一个单位为K的化学势,这个就是第二步计算吸附时的化学势输入量(此时已经将吸附剂加入盒子)。

你是指固定的分子数码? 也就是先跑NVT系综的MC,此时能得到体系的化学势,然后再将这个化学势作为输入量跑UVT系综的MC。可是第一步的分子数的值怎么确定?因为这个值必定跟体系的压强有关。
5楼2010-09-23 09:28:54
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yazhiyang

新虫 (初入文坛)

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zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-09-28 08:19:53
两种方法,一种你用状态方程去算一个,PR或者SRK都可以,但是你要看看这个状态方程适用的压力和温度范围。第二就是去跑一个空盒子的模拟,NPT或者NVT都可以,让Towhee输入压力和化学势就好了,时间花费要久一点。
7楼2010-09-28 07:07:35
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zyj8119

木虫 (著名写手)


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引用回帖:
Originally posted by yazhiyang at 2010-09-28 07:07:35:
两种方法,一种你用状态方程去算一个,PR或者SRK都可以,但是你要看看这个状态方程适用的压力和温度范围。第二就是去跑一个空盒子的模拟,NPT或者NVT都可以,让Towhee输入压力和化学势就好了,时间花费要久一点。

你哪个组的?
好好学习,天天向上。
8楼2010-09-28 08:29:44
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紫霞咸鱼

新虫 (小有名气)


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楼主  你这个化学势算出来了么    我也是用GCMC做吸附,这个空盒子怎么跑呢?懵
9楼2017-05-26 16:47:06
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Atmoschem

新虫 (初入文坛)


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引用回帖:
3楼: Originally posted by ghcacj at 2010-09-22 19:16:23
不是这样的,我记得是先将固定的分子放入一个空盒里,跑MC,会计算出一个单位为K的化学势,这个就是第二步计算吸附时的化学势输入量(此时已经将吸附剂加入盒子)。...

请问一下,这个化学势单位K和kJmol-1 的关系是什么?

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10楼2017-05-27 00:20:05
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