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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【讨论】Gaussian09的内存控制很奇特？
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小红豆(金币+3):感谢交流 2010-09-20 15:49:49
楼主的问题是在Linux下产生的，为什么设置那么大的内存限用量在实际计算时却没有用到呢？这样的结果影响计算速度？希望大家讨论。
我这里的条件差，还没用上Linux版本，无法探讨上述问题，但在Win下面，一旦设置了内存，则系统会毫不留情地划出设定量来，不管你实际计算需要与否，绝不会出现基组不同因而实际使用的内存量不同的情况。
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11楼2010-09-19 16:32:01
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by sculhf at 2010-09-19 15:57:12:

其他的也在运行
网页、WORD、。。。都要占用一定的内存，所以我说内存使用1.5GB
就不足为奇了
这个我想应该都知道吧?

哎，惭愧！班门弄斧了！我错了……
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前途光明，出路难觅！
12楼2010-09-19 16:40:45
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★ ★
小红豆(金币+2):感谢分享 2010-09-20 15:50:06
引用回帖:
Originally posted by quantumor at 2010-09-19 16:32:01:
楼主的问题是在Linux下产生的，为什么设置那么大的内存限用量在实际计算时却没有用到呢？这样的结果影响计算速度？希望大家讨论。
我这里的条件差，还没用上Linux版本，无法探讨上述问题，但在Win下面，一旦设置 ...

这个很可能与gaussian的并行效率有关。我在学校公共节点上运行，可能会涉及到跨节点并行，因此有这样的情况，但我在本地4核linux下运行，就完全显示正确。
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惺惺相惜情不自禁
13楼2010-09-19 16:54:09
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sculhf

荣誉版主 (知名作家)

断翼天使

优秀版主优秀版主
★ ★
小红豆(金币+2):感谢分享 2010-09-20 15:50:23
引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2010-09-19 16:15:11:


有点晕 楼主的问题是不是 尽管设置的mem一样，但是DFT的不同方法占用的内存不一样？

你理解偏了
Gaussian09尽管设置的%mem=5GB
DFT下为什么只有执行STO-3G基组时
机器内存占用1.2~1.8GB(35%左右)
反而用大基组（6-311++G**/TZVP....）执行时内存占用小（0.8GB左右）(此时仍取%mem=5GB)
所以觉得很怪异
方便的话 你也可以自己去测试一下嘛
（PS: 以上的计算结果都是在完全相同一个分子体系下测试的）

[ Last edited by sculhf on 2010-9-19 at 17:00 ]
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谋事在人成事在天
14楼2010-09-19 16:56:47
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calfwoo

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小红豆(金币+2):感谢分享 2010-09-20 15:50:35
有没有这种可能？：

STO-3G计算时，一样相关的数据只存于内存；
而后来发展的基组计算时，都将那些数据存于rwf文件。

纯属瞎猜。
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15楼2010-09-19 18:26:26
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faqianliu

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我的也出现这种问题，我使用的g03 e01，设定10G内存，b3lyp/lanl2dz 优化80个原子竟然只给我用800M,我撞墙。。。。后来删除e01，改用D01，问题依旧，放着大内存用不上，只有在td的时候会用到，郁闷哪。。。。
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16楼2010-09-19 18:57:44
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sculhf

荣誉版主 (知名作家)

断翼天使

优秀版主优秀版主
引用回帖:
Originally posted by faqianliu at 2010-09-19 18:57:44:
我的也出现这种问题，我使用的g03 e01，设定10G内存，b3lyp/lanl2dz 优化80个原子竟然只给我用800M,我撞墙。。。。后来删除e01，改用D01，问题依旧，放着大内存用不上，只有在td的时候会用到，郁闷哪。。。。

你的是800MW还是MB?
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谋事在人成事在天
17楼2010-09-19 20:59:07
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
13楼所说的原因的可能性较大哦。
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18楼2010-09-19 21:53:43
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faqianliu

银虫 (小有名气)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小红豆(金币+2):感谢分享 2010-09-20 15:50:54
引用回帖:
Originally posted by sculhf at 2010-09-19 20:59:07:

你的是800MW还是MB?

800M，我的linux下开了一个XP虚拟机，开XP时总占用1.5G,关了XP，就只剩下8XXM了

利用TD计算时，内存很快会升到8G左右，难道优化本来占用内存就小？
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19楼2010-09-19 22:26:35
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sculhf

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断翼天使

优秀版主优秀版主
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小红豆(金币+2):感谢分享 2010-09-20 15:51:36
引用回帖:
Originally posted by faqianliu at 2010-09-19 22:26:35:


800M，我的linux下开了一个XP虚拟机，开XP时总占用1.5G,关了XP，就只剩下8XXM了

利用TD计算时，内存很快会升到8G左右，难道优化本来占用内存就小？

占用内存应该与方法、基组、以及分子体系大小有关
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谋事在人成事在天
20楼2010-09-19 23:45:49
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