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【求助】逐一法交叉验证相关系数
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songbin7957
木虫
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注册: 2008-11-01
性别: GG
专业: 分析化学
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【求助】逐一法交叉验证相关系数
已有1人参与
各位大侠,我再回归得到参数方程之后,为验证方程的稳定性,需要求一下交叉验证相关系数,该怎么求,请帮帮忙,先谢谢了
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1楼
2010-09-17 13:48:25
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djl2008d
木虫
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性别: GG
专业: 环境化工
★
luoqiquan(金币+1):thank you 2010-11-05 20:30:15
用一个软件:Tsar可以计算出来,我也是一直没找到这个软件,问了好多人都没问到,后来就不做了
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一定要坚持,坚持就是胜利
2楼
2010-11-05 10:26:04
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snoopyzhao
至尊木虫
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专业: 污染生态化学
★ ★ ★ ★ ★
luoqiquan(金币+5, 计算强帖+1):thank you very much 2010-11-05 20:30:43
贴一个我用 R 语言写的 LOO-LGO CV 的程序,应该能够看得懂,至于其它语言如何实现,我就无能为力了……
CODE:
lmcv <- function(obj, ng = NULL, random = FALSE) {
#
# The Leave-One-Out (LOO) and/or Leave-Group-Out (LGO) Cross-Validation in R for (Multiple) Linear Regression.
#
# Input:
# obj: the model of MLR
# ng: number of group, if missing, do LOO
# random: logical, if TRUE, do random CV
#
# Output:
# q.squared: cross-validation relation coefficient.
# SDEP: Standard Deviation of Error of Predictions
# newsq: variance in Y explained only for LOO CV
#
# Usage:
# loo <- cv.lm(obj)
# lgo <- cv.lm(obj, ng = 5)
#
data <- data.frame(y = obj$model[,1], x = obj$model[, -1])
col.names <- colnames(data)
N <- nrow(data)
if (random == TRUE) data <- data[sample(1:N),]
if (missing(ng)) ng <- N # LOO CV
ytest <- numeric(N)
ypred <- numeric(N)
newrsq <- numeric(ng)
g <- N %/% ng
for (i in 1:ng) {
if (g == 1) {
index <- i
}
else {
index <- c(i, ng * seq(1, (g - 1)) + i)
if (N %% ng != 0 & i <= N %% ng) index <- c(index, (g * ng + i))
}
ytest[index] <- data[index,1]
newtrain <- data[-index, ]
xtest <- data.frame(x = data[index, -1])
colnames(xtest) <- col.names[-1]
newfm <- lm(y ~., data = newtrain)
newrsq[i] <- summary(newfm)$r.squared
ypred[index] <- predict(newfm, xtest)
}
q.squared <- 1 - sum((ytest - ypred)^2) / sum((ytest - mean(ytest))^2)
SDEP <- sqrt(sum((ytest - ypred)^2) / N)
return(list(q.squared = q.squared, SDEP = SDEP, newrsq = newrsq))
}
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3楼
2010-11-05 20:09:14
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snoopyzhao
至尊木虫
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在线: 1422.4小时
虫号: 183750
注册: 2006-02-13
专业: 污染生态化学
这个贴子很久以前我好象回复过,不是在这里……
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4楼
2010-11-05 20:11:01
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vltava
木虫
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专业: 合成药物化学
★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼
:
Originally posted by
snoopyzhao
at 2010-11-05 20:09:14:
贴一个我用 R 语言写的 LOO-LGO CV 的程序,应该能够看得懂,至于其它语言如何实现,我就无能为力了……
[code]
lmcv <- function(obj, ng = NULL, random = FALSE) {
#
# The Leave-One-Out (LOO) and/ ...
楼主回的这个帖是说算RMSEC和RMSECV的吗?
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人生本来就有很多事是徒劳无功的
5楼
2011-11-07 19:29:43
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