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端木青

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】各位路过的大虫,做过discover的大虫!请留步 已有3人参与

我做discover有这样的错误,该怎么办?谢谢指点啊!
MOLECULAR DYNAMICS
__________________

Ensemble           :       NVT

Temperature        :    298.00 K
Control Method     :   Andersen, Collision frequency is every 84 steps

Timestep           :      1.00 fs
Duration           :    500.00 fs
Integration Method : Velocity Verlet

Initial Velocities :   Random Velocities from Boltzmann distribution
Initial Temp.      :    298.00 K


Error: Dynamics: Energy difference between successive steps in dynamics is greater than the user defined variable DEVIATION,  5000.000
    invoked from within
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端木青

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 石油黑人 at 2010-09-15 11:29:50:
先用discover中的minimize优化一下你的模型,然后再运行

谢谢大虫
5楼2010-09-15 12:43:11
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siga5609

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):感谢回复 2010-09-15 15:54:59
结构的能量太高了……
1、能量最小化了么?
2、更改Energy DEVIATION
愚蠢的地球人,受死吧!哇哈哈哈……
2楼2010-09-15 11:23:16
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石油黑人

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):感谢回复 2010-09-15 15:54:55
先用discover中的minimize优化一下你的模型,然后再运行
生活在白色恐怖之下,一样搞科研
3楼2010-09-15 11:29:50
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端木青

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by siga5609 at 2010-09-15 11:23:16:
结构的能量太高了……
1、能量最小化了么?
2、更改Energy DEVIATION

谢谢 以上各位大虫!
4楼2010-09-15 12:42:44
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