应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】atk中双电极求出中间分子的态密度方法
31/1返回列表
查看: 374  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

kaypu

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】atk中双电极求出中间分子的态密度方法

atk的2008.10版本中计算态密度时，所得到的态密度是电极与分子的态密度。我想在这个双电极系统中得到中间分子的态密度，有什么方法吗？
第一个：求出PDOS，这个atk中没有求PDOS的，在官网论坛上有人分享了代码，说是可以求出PDOS，忘有人能够分享一下，非常感谢。
第二个：有个方法是求出电极与分子的总的态密度，然后单独计算没有分子的电极的态密度，将两个态密度相减得出中间分子的态密度。这个方法的可信度是多少？ 分子与电极耦合后的态密度是两个单独的态密度的叠加吗？ 或是说可以认为是线性叠加，只是中间差一个系数，类似于A=aX+bY这样的线性形式。有篇文章jcp的上面写着The DOS here is the difference between the DOSs of two-electrode system with and without the molecule core in between。  这个是文章JChemPhys_129_094702。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2010-09-12 16:37:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
kaypu(金币+2):怎么样展宽成平滑的态密度？ 这个projected_hamiltonian_eigenstates，计算出来的不就是中间分子的能级，是以图的形式出来的就是那种homo轨道图，如何展宽成态密度呀 2010-09-12 19:55:22
zzy870720z(金币+1):谢谢指教 2010-09-13 08:11:26
引用回帖:
Originally posted by kaypu at 2010-09-12 09:37:46:
atk的2008.10版本中计算态密度时，所得到的态密度是电极与分子的态密度。我想在这个双电极系统中得到中间分子的态密度，有什么方法吗？
第一个：求出PDOS，这个atk中没有求PDOS的，在官网论坛上有人分享了代码， ...

这个akt-2008.10好像实现不了。不过你可以先计算一下projected_hamiltonian_eigenstates，然后自己展宽成比较平滑的态密度就行了。只不过这个展宽是有任意性的。这个也可以说明问题。
赞一下(1人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
2楼2010-09-12 17:34:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-09-12 10:34:54:

这个akt-2008.10好像实现不了。不过你可以先计算一下projected_hamiltonian_eigenstates，然后自己展宽成比较平滑的态密度就行了。只不过这个展宽是有任意性的。这个也可以说明问题。

这个需要自己编写程序实现吧。可以用高斯展宽或者洛伦兹展宽。不过我没有编写过。不过你可以借鉴一下siesta里面有一个eig2dos的代码，你先把你的本征值写成siesta的*EIG输出文件的格式，然后就可以实现了。
赞一下 回复此楼
弘德明志博学笃行
3楼2010-09-13 08:55:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kaypu 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 315分求调剂 +4 26考研上岸版26 2026-03-26 4/200 2026-03-26 10:20 by king123！
[考研] 总分293求调剂 +5 加一一九 2026-03-25 7/350 2026-03-26 10:19 by 王小欠i
[考研] 0703化学/290求调剂/本科经历丰富/工科也可 +3 丹青奶盖 2026-03-26 3/150 2026-03-26 10:06 by yeahyou
[考研] 289求调剂 +15 硕星赴 2026-03-23 15/750 2026-03-26 02:16 by BruceLiu320
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 一志愿河工大 081700 276求调剂 +3 地球绕着太阳转 2026-03-23 3/150 2026-03-25 19:10 by 雾散后相遇lc
[考研] 0854人工智能方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-24 4/200 2026-03-25 13:29 by 2177681040
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 085600材料与化工调剂 +9 A-哆啦Z梦 2026-03-23 15/750 2026-03-25 11:18 by Ainin_
[考研] 生物学学硕求调剂 +7 小羊睡着了? 2026-03-23 10/500 2026-03-25 02:24 by 清风拂扬。 m
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
[考研] 一志愿070300浙大化学358分，求调剂！ +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 材料与化工085600，总分304，本科有两篇sci参与，求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 一志愿华中农业071010，总分320求调剂 +5 困困困困坤坤 2026-03-20 6/300 2026-03-22 17:41 by hxsm
[考研] 303求调剂 +5 安忆灵 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:46 by 素颜倾城1988
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 一志愿南大，0703化学，分数336，求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭