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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】autodock3.05中如何识别卤素原子？
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lvyanniwin

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】autodock3.05中如何识别卤素原子？

各位大侠好：
       在做autodock3.05中对接时发现不能识别卤素原子，如F等，开始做过CL原子，则自动识别成碳原子，显然是不对的。
      请问下在autodock3.05中怎样修改参数才可以使得卤素原子被识别，谢谢了，比较着急，欢迎大家踊跃发言，感激不尽。
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1楼 2010-09-12 09:47:33
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-09-12 18:21:14
lvyanniwin(金币+5): 2011-02-25 08:55:14
引用回帖:
Originally posted by lvyanniwin at 2010-09-12 09:47:33:
各位大侠好：
       在做autodock3.05中对接时发现不能识别卤素原子，如F等，开始做过CL原子，则自动识别成碳原子，显然是不对的。
      请问下在autodock3.05中怎样修改参数才可以使得卤素原子被识别，谢谢了 ...

为什么不用4.0以上的版本呢？都可以自动识别的啊~
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2楼2010-09-12 09:52:30
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lvyanniwin

木虫 (正式写手)
不好意思，刚刚初学，不会安装，实验室只安装了autodock4.0的版本，所以比较郁闷。
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3楼2010-09-12 09:59:34
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-09-12 18:21:23
引用回帖:
Originally posted by lvyanniwin at 2010-09-12 09:59:34:
不好意思，刚刚初学，不会安装，实验室只安装了autodock4.0的版本，所以比较郁闷。

汗，怎么安装都是基本功啊~万一哪天实验室电脑坏了，以后还用不用呢？呵呵~看你的意思，应该是只装了3.5吧~用4确实会方便很多
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4楼2010-09-12 10:58:21
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