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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】帮忙VASP写个小程序
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wo8165827

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】帮忙VASP写个小程序 已有4人参与

用Linux帮忙VASP写个小程序，

要求：
1 查找到某一目录下文件夹中的OZSICAR
2 提取OZSICAR中最后一个E0的数据，如提取“ E0= -.73812181E+01”  （OZSICAR中有很多E0）
3 将提取的E0数据放到一个文件下"log"
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计算的魅力
1楼 2010-09-11 15:50:16
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wangle_xq

银虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wo8165827(金币+5):谢谢您的提示。太感谢了。 2010-09-13 13:51:24
aylayl08(金币+1):谢谢提示 2010-09-15 15:46:39
引用回帖:
Originally posted by wo8165827 at 2010-09-13 11:12:46:
谢谢您的提示。
这是我的run.sh文件内容：

#!/bin/bash
grep "E0=" */OSZICAR | tail -1 | awk '{print $6}' >>log

我要提取E0的文件夹很多如：
[img]http://pic.muchong.com/201 ...

发完了才想起来，关于OSZICAR中的能量值。如果有多个，是由于几何优化产生的结果。VASP的手册上曾经有这么一段记述。在使用能量值的时候，不要使用几何优化产生的能量，要在几何优化结束以后另外固定原子位置和晶胞。所以一般在最后提取OSZICAR中能量时只有一行能量。
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网络日志 http://blog.163.com/wangle_xq/ 关注计算材料科学的应用，以及相关的计算机技术。文章以转贴为主，少量原创。欢迎参观
20楼2010-09-13 13:35:20
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查看全部 22 个回答

huangyc

木虫 (正式写手)
★
wo8165827(金币+5): 2010-09-11 17:16:12
cenwanglai(金币+1):谢谢提示。 2010-09-12 11:53:01
晕

grep F OSZICAR  > log
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2楼2010-09-11 16:23:07
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wo8165827

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by huangyc at 2010-09-11 16:23:07:
晕

grep F OSZICAR  > log

这个能提取E0的数据吗？我只要最后一个数据呢？

[ Last edited by wo8165827 on 2010-9-11 at 17:16 ]
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计算的魅力
3楼2010-09-11 16:41:50
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
★
wo8165827(金币+5):谢谢 2010-09-11 18:51:15
zzy870720z(金币+1):谢谢指点 2010-09-12 09:17:10
引用回帖:
Originally posted by wo8165827 at 2010-09-11 16:41:50:



这个能提取E0的数据吗？我只要最后一个数据呢？

[ Last edited by wo8165827 on 2010-9-11 at 17:16 ]

grep "E0= " OZSICAR | tail -1 | tee log
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4楼2010-09-11 17:26:55
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