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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS forcite动力学问题
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tjufyn

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】MS forcite动力学问题

请问各位虫友我的一个体系用Forcite先进行了5000步几何优化，然后进行了time step 1fs，100000步的MD预平衡，NVT系综，compass力场。发现温度波动没有达到要求的5K以内，然后又用这个轨迹文件又进行了100000的MD预平衡。但是这两次的温度曲线一模一样。难道不是应该在上一次100000结束后的温度下开始进行下一次100000的MD过程吗？
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大家好
1楼 2010-08-24 08:29:55
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apavel

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主，你这个Forcite dynamics 是怎样跑出这种震荡的形式呢？我用anneal就只有正玄图，用dynamics 就只有一条平滑线，请教啊！
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12楼2014-07-31 11:23:56
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siga5609

木虫 (小有名气)
★
ym23(金币+1):欢迎常来讨论 2010-09-07 21:02:58
我也想知道是为什么……是不是恒温的方式不妥？
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愚蠢的地球人，受死吧！哇哈哈哈……
2楼2010-09-07 19:52:33
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Tower.Tsu

金虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-09-08 09:57:46
tjufyn(金币+3): 2010-09-08 14:29:43
要在上一次的结果上继续MD，Initial velocities：需要选择Current
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不再是一个人，处处时时想着念着的都是我们...
3楼2010-09-08 09:37:04
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Tower.Tsu

金虫 (著名写手)
★
ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-09-08 11:47:26
tjufyn(金币+3): 2010-09-08 14:29:50
没猜错的话你应该仍然用的是Rondom
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不再是一个人，处处时时想着念着的都是我们...
4楼2010-09-08 09:38:12
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