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acnes

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于计算轨道组分的错误

计算了几个多环有机分子(原子数80~90),想要得到homo,lumo轨道每个环所占的组分是多少。使用了Gausssum处理log文件,相关的一些关键字都加上了。其中有两个gausssum都正常处理了,但是有一个打开log文件的时候,却出现如下错误:

cclib has problems parsing ***.log

捅咕半天也不行,然后就想自己excell算一下,
199 13  C  1S          0.00682  -0.00217  -0.00195  -0.00344   0.00114
200        2S         -0.01561   0.00388   0.00508   0.01075   0.00028
201        2PX         0.06324   0.02385  -0.05685  -0.04243   0.07870
202        2PY        -0.01672  -0.00381   0.01409   0.00702  -0.00202
203        2PZ        -0.06454  -0.00606   0.04210   0.05848  -0.06806
204        3S         -0.03634   0.02265   0.00528   0.00409  -0.03404
205        3PX         0.05359   0.01946  -0.04873  -0.04136   0.08815
206        3PY         0.02392  -0.00947  -0.00515  -0.01684   0.00449
207        3PZ        -0.03383  -0.00203   0.02422   0.05046  -0.08401
208        4S         -0.02705   0.24847  -0.15761  -1.48490  -0.49161
209        4PX         0.11231   0.01142  -0.05390   0.01341   0.44790
210        4PY         0.32945  -0.01356  -0.08825   0.32342   0.73343
(截取的一段轨道)
想问一下,这个怎么算呢?
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acnes

金虫 (正式写手)

哦,excell我弄明白了,就是把所有的轨道做平方和,然后再把对应环的原子的所有轨道做平方和,后者比上前者就可以得到相应轨道 某个部分所占的比例了。。。原来结构就学过。。。
2楼2010-08-23 12:57:23
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by acnes at 2010-08-23 12:57:23:
哦,excell我弄明白了,就是把所有的轨道做平方和,然后再把对应环的原子的所有轨道做平方和,后者比上前者就可以得到相应轨道 某个部分所占的比例了。。。原来结构就学过。。。

免费软件vmodes,做这个很在行,比咱们自己统计快
3楼2010-08-23 14:19:35
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