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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】如何读懂进化树
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88259654

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
学习了
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11楼2010-08-20 11:42:53
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木子

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看天(金币+2):鼓励回答 2010-08-20 13:57:48
刻度线代表的是进化距离刻度标尺，就是说通过这个刻度标尺可以看出不同序列的进行差异大小，图上的100、66、71等数字是用bootstrap算出来的，代表构建的进化树的可信度，一般在70%以上是可信的。
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12楼2010-08-20 11:48:29
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jinxiaoli9

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也在建树，可是我的树的自展值会很小呢，也就是建好的树的节点处显示的值都小于70，有的甚至只有个位数。这代表的什么？是我的操作有问题还是选择的bootstrap的参数有问题？请知道的帮忙解答一下。谢谢了！
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简单、宁静。
13楼2010-09-29 16:23:47
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111602

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by jinxiaoli9 at 2010-09-29 16:23:47:
我也在建树，可是我的树的自展值会很小呢，也就是建好的树的节点处显示的值都小于70，有的甚至只有个位数。这代表的什么？是我的操作有问题还是选择的bootstrap的参数有问题？请知道的帮忙解答一下。谢谢了！

注意你建树的方法，和重复比较次数设置。
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14楼2010-09-29 16:35:10
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changhl

金虫 (小有名气)
??ing
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15楼2010-10-23 11:51:31
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火舞精灵3

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
1454787楼: Originally posted by 111602 at 2010-08-18 11:25:43:
本人最近做了一个进化树，请大家参谋一下具体是什么意思。这方面本人刚接触。
一般认为都是Neighbor-joining analysis分析作的树。但本人用MEGA做的，用到这样的参数
No. of Taxa : 9
Data File : C:\Document ...

学习
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翻新核弹头,回收二手航母,大修核反应堆,航天飞机保养换三滤,高空作业擦洗卫星表面积尘,南极冰川修复,提供原子对撞机,提供捕捉反物质原子技术支持
16楼2012-04-15 17:38:15
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yanjing1990

铁虫 (小有名气)
??
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没有努力，就没有未来！
17楼2012-07-21 12:39:57
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水墨

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2303967楼: Originally posted by 111602 at 2010-09-29 16:35:10
注意你建树的方法，和重复比较次数设置。...

这个能具体说明一下吗？怎样设置比较次数？
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18楼2012-09-11 19:34:41
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cherylshen

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
对那些可信度小的树，怎么具体处理？
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19楼2013-04-13 10:54:08
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lovegao
20楼2015-03-11 20:24:49
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