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caiyupin

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】链置换活性已有4人参与

大家好,最近看恒温扩增的文献,有很多聚合酶都有链置换的活性(stand displacement activity),比如Bst,Phi29,exo- Klenow, 但一直没有找到文献来说链置换的原理是什么, 不知道版上有没有人关注过这个问题?
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cexoihtydx

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
西瓜(金币+5, MolEPI+1): Good!学习了! 2011-09-30 20:34:22
具有链置换活性的DNA聚合酶不具有5‘->3’的核酸外切酶活性。外侧引物结合在模板链上,在聚合酶作用下向下游延伸,遇到下游内侧引物延伸合成的双链时,因不具有5‘->3’的核酸外切酶活性,无法将内侧引物的合成链切除,只能继续在聚合酶作用下,将内侧引物的合成链置换出去,形成置换链。而具有5‘->3’的核酸外切酶活性的DNA聚合酶,遇到内侧引物的合成链时将会把内侧引物的合成链切除掉,无法形成置换链。
比如:Taq DNA 聚合酶,具有5‘->3’的核酸外切酶活性,将会出现下图的结果

而具有链置换活性的DNA聚合酶,将会置换出图中前端的合成链,形成置换。

[ Last edited by cexoihtydx on 2011-9-30 at 20:35 ]
不放弃,日子总有阳光,追求总有希望!
2楼2011-09-30 20:23:49
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sincere32

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by cexoihtydx at 2011-09-30 20:23:49
具有链置换活性的DNA聚合酶不具有5‘->3’的核酸外切酶活性。外侧引物结合在模板链上,在聚合酶作用下向下游延伸,遇到下游内侧引物延伸合成的双链时,因不具有5‘->3’的核酸外切酶活性,无法将内侧引物的合 ...

7年前的回复了。想问,只是没有5到3外切能力,链置换的DNA聚合酶需要DNA解链吗?或者比通常70度以上的解链温度低很多吗?比如42度
3楼2018-06-06 13:44:08
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justavril

银虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by sincere32 at 2018-06-06 13:44:08
7年前的回复了。想问,只是没有5到3外切能力,链置换的DNA聚合酶需要DNA解链吗?或者比通常70度以上的解链温度低很多吗?比如42度...

又三年了,不需要解链,37度可置换下来(EXPAR等恒温扩增文献如是说…)
4楼2021-11-11 10:02:05
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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5楼2022-06-16 10:59:04
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