| 查看: 560 | 回复: 0 | |||
sijifengsd银虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助】急-sybyl基于receptor的重叠怎么做？
|
|
大家好： 本人在用sybyl做分子设计，对于我做的体系开始是基于ligand的叠合。但是审稿人说既然有晶体的结构，怎么不基于受体的叠合也做一下？晕，还的按照人家的意思做。我现在配体小分子已经对接到结合口袋里面了，现在就差叠合的这一步了，但是有点问题不懂： 1 做基于配体的时候需要选择活性最高的分子作为模板，并且要选择一个骨架，那么在做基于receptor的叠合还要选择模板么？ 2 如果不需要的话，就是从File--read读入就可以了，那么小分子的活性构象以什么格式读入？pdb还是mol2格式？读入的时候是先读小分子，再读大分子；还是大分子和小分子放在一起读入？我发现读完小分子，再读protein建立数据表格时大分子也别当做一个小分子显示在表格里面了。 3 在做COMFA的时候我不知道是不是也要带着蛋白一起做，还是和做基于ligand的时候那样光是那些小分子在那里处理，然后显示的时候在补充上蛋白质分子 很困惑，不知道怎么解决，希望高手给予指点。 [ Last edited by sijifengsd on 2010-8-9 at 18:33 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
厦门大学侯旭团队招聘青年教师、博士后及博硕士研究生
已经有2人回复
-
哈工大深圳 表界面物理化学方向（胶体与界面，光谱探测研究） 博士招生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有223人回复
-
元素硫的化合价和氧化态
已经有1人回复
-
江苏科技大学2026年招聘启事
已经有2人回复
-
International Journal of Nanoscience属于中科院4区吗？
已经有0人回复
-
面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！
已经有37人回复
-
澳大利亚南昆士兰大学量子点课题组招收博士生
已经有1人回复
-
香港中文大学（深圳）2026年招聘公告
已经有0人回复
-
北京工业大学2026年公开招聘公告
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
