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ymzfeng

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于拟南芥野生型问题 已有1人参与

拟南芥野生型和拟南芥生态型不是一回事吧?
拟南芥生态型一般有三种:Col、Ws、Ler
Col是Columbia(哥伦比亚),是George Redei在Columbia的University of Missouri研究的一种拟南芥株系,以密苏里大学所在地Columbia命名。
Ler是Landsberg erecta(兰兹贝格),是Friedrich Laibach在德国Landsberg附近研究的一个拟南芥株系,因此命名为Landsberg。事实上,Columbia was isolated from Landsberg。
Ws是Wassileskija(瓦斯莱)。可能根据人名命名
此外,还有RLD较常用。RLD:
Natural accession genotyped with 149 genome-wide SNPs by the Justin Borevitz laboratory (University of Chicago, USA) in a study of genetic diversity and population structure of Arabidopsis thaliana in world-wide collections.
这些不同的生态型拟南芥都应该都是属于野生型拟南芥吧?
只是不同的生态型是来自不同的地区,那么这不同的生态型其基因组序列或说一些基因的序列是不是就不一样了?
目前我们测序的拟南芥全基因组序列是测得那种生态型拟南芥的序列了?
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fungixx

至尊木虫 (文坛精英)

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★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2):鼓励一个! 2010-08-08 18:38:20
不是一回事
没有转基因或者突变的各种生态型的拟南芥都是野生型的啊  
测序的好像是 哥伦比亚型
几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
2楼2010-08-08 18:17:37
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