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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 【调查】大伙都喜欢几核并行
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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 【调查】大伙都喜欢几核并行 已有20人参与

先引用一个老帖子:


　　　集群测试环境：
　　　操作系统：CentOS4
　　　1个管理节点：2×CPU5410 16G内存 5×300GSAS硬盘做RAID5
　　　8个计算节点：2×CPU5410 16G内存 2×143GSAS硬盘RAID0
　　　以太网络链接：千兆网，TCP/IP协议
　　　G03D01并行版（Linda7.1）
　　　任务说明：主要测试并行SCF，共882个基函数，无对称性。
　　　======================
　　　CPU数  运行时间  效能
　　　  n       xn      e
　　　--------------------
　　　  1       1920 　
　　　  2       1314   1.168  
　　　  4        803   1.157  
　　　  6        611   1.334  
　　　  8        527   1.648  
　　　  10       479   1.992  
　　　  12       455   2.416  
　　　  14       434   2.797  
　　　  16       432   3.355  

感觉这个应该是一段时间以前的测试了, 一个节点里只有两个CPU, 看很多新的电脑集群都是8CPU了, 单节点8CPU运行肯定比上面例子里的8CPU快不少

看看大伙都用什么并行

[ Last edited by tiechong on 2010-8-5 at 05:13 ]
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1楼 2010-08-05 05:05:58
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1098835楼: Originally posted by beefly at 2010-08-06 11:50:02
依赖于程序的代码。

Gaussian的4cpu/1节点，8cpu/2节点，16cpu/4节点并行效率都不错，

而molpro在默认情况下2cpu/1节点效率最高，4cpu/1节点以上反而慢几十倍，除非把任务平均分配在多个节点，每节点使用不超 ...

高斯的并行效率还需要看计算的什么内容吧？
我知道的是结构的优化高斯单节点并行效率比较高。
但是我发现用高斯算TDDFT激发态性质，并行效率不咋的。
还有就是高斯算频率，给他8个核，大部分时间都是1个核在工作。
是不是有这个情况呢？
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弘德明志博学笃行
22楼2012-07-30 19:45:20
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
常用  1 node 4 CPU
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2楼2010-08-05 08:16:39
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
依赖于程序的代码。

Gaussian的4cpu/1节点，8cpu/2节点，16cpu/4节点并行效率都不错，

而molpro在默认情况下2cpu/1节点效率最高，4cpu/1节点以上反而慢几十倍，除非把任务平均分配在多个节点，每节点使用不超过2cpu，才能提高计算速度，但是很麻烦。
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2010-08-06 11:50:02
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easygeton

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这个和高斯的版本也有关系：
高斯03一般4-8cpu做DFT优化，2-4cpu算频率或者高精度计算。
高斯09进一步提高了并行程度，我用8cpu的感觉基本上加速了8倍，估计16cpu也可以并行的不错。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-08-07 20:03:00
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