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tiechong

金虫 (著名写手)

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专业: 无机药物化学
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[交流] 【调查】大伙都喜欢几核并行已有20人参与

先引用一个老帖子:

　　　集群测试环境：
　　　操作系统：CentOS4
　　　1个管理节点：2×CPU5410 16G内存 5×300GSAS硬盘做RAID5
　　　8个计算节点：2×CPU5410 16G内存 2×143GSAS硬盘RAID0
　　　以太网络链接：千兆网，TCP/IP协议
　　　G03D01并行版（Linda7.1）
　　　任务说明：主要测试并行SCF，共882个基函数，无对称性。
　　　======================
　　　CPU数  运行时间  效能
　　　  n    xn    e
　　　--------------------
　　　  1    1920 　
　　　  2    1314 1.168
　　　  4       803 1.157
　　　  6       611 1.334
　　　  8       527 1.648
　　　  10    479 1.992
　　　  12    455 2.416
　　　  14    434 2.797
　　　  16    432 3.355

感觉这个应该是一段时间以前的测试了, 一个节点里只有两个CPU, 看很多新的电脑集群都是8CPU了, 单节点8CPU运行肯定比上面例子里的8CPU快不少

看看大伙都用什么并行

[ Last edited by tiechong on 2010-8-5 at 05:13 ]

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1楼 2010-08-05 05:05:58

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

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★
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引用回帖:

1098835楼: Originally posted by beefly at 2010-08-06 11:50:02
依赖于程序的代码。

Gaussian的4cpu/1节点，8cpu/2节点，16cpu/4节点并行效率都不错，

而molpro在默认情况下2cpu/1节点效率最高，4cpu/1节点以上反而慢几十倍，除非把任务平均分配在多个节点，每节点使用不超 ...

高斯的并行效率还需要看计算的什么内容吧？
我知道的是结构的优化高斯单节点并行效率比较高。
但是我发现用高斯算TDDFT激发态性质，并行效率不咋的。
还有就是高斯算频率，给他8个核，大部分时间都是1个核在工作。
是不是有这个情况呢？