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mybeerbear

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】急问:环形基因组起始位置如何确定已有3人参与

本人是基因组学新手,想问一下诸位,对于环形基因组(如细菌基因组),如何确定基因组中的 1bp 的位置?对于线的基因组有如何确定?是否有相关文献,书籍讲解?
非常感谢!!!
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silicare

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
质粒?
人为规定
2楼2010-08-02 10:28:03
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zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
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看天(金币+1):鼓励交流 2010-08-03 12:04:32
首先得找到复制起始区
我有一个梦想,我梦想有一天,我们的人民可以根据自己的意愿与消费能力,居住在自己愿意居住的地方。
3楼2010-08-02 18:20:11
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mybeerbear

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by silicare at 2010-08-02 10:28:03:
质粒?
人为规定

不是质粒,是细菌基因组。细菌环形基因组转为fasta格式后,那个位置是第一位?
4楼2010-08-03 08:41:22
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mybeerbear

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by zhaohq1209 at 2010-08-02 18:20:11:
首先得找到复制起始区

你确定吗?那线粒体基因组呢?如果测序未拼接出起始区呢?
5楼2010-08-03 08:43:05
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silicare

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看天(金币+1):鼓励交流 2010-08-03 12:04:19
哦,就知道质粒,细胞器,病毒基因组有环形的,细菌基因组那得多大一个环啊

既然是环形那就无所谓谁第一了

找到ori复制起点就可以了

fasta格式本身就是人为规定的
6楼2010-08-03 09:56:18
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zhaohq1209

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引用回帖:
Originally posted by mybeerbear at 2010-08-03 08:43:05:

你确定吗?那线粒体基因组呢?如果测序未拼接出起始区呢?

LZ的是线粒体基因组?
我有一个梦想,我梦想有一天,我们的人民可以根据自己的意愿与消费能力,居住在自己愿意居住的地方。
7楼2010-08-03 11:56:35
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mybeerbear

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by zhaohq1209 at 2010-08-03 11:56:35:

LZ的是线粒体基因组?

不是,是细菌基因组。
8楼2010-08-03 19:26:16
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