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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】急问：环形基因组起始位置如何确定
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mybeerbear

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】急问：环形基因组起始位置如何确定 已有3人参与

本人是基因组学新手，想问一下诸位，对于环形基因组（如细菌基因组），如何确定基因组中的 1bp 的位置？对于线的基因组有如何确定？是否有相关文献，书籍讲解？
非常感谢！！！
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1楼 2010-08-02 10:01:00
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silicare

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质粒？
人为规定
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2楼2010-08-02 10:28:03
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zhaohq1209

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看天(金币+1):鼓励交流 2010-08-03 12:04:32
首先得找到复制起始区
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3楼2010-08-02 18:20:11
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mybeerbear

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by silicare at 2010-08-02 10:28:03:
质粒？
人为规定

不是质粒，是细菌基因组。细菌环形基因组转为fasta格式后，那个位置是第一位？
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4楼2010-08-03 08:41:22
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mybeerbear

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zhaohq1209 at 2010-08-02 18:20:11:
首先得找到复制起始区

你确定吗？那线粒体基因组呢？如果测序未拼接出起始区呢？
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5楼2010-08-03 08:43:05
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silicare

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看天(金币+1):鼓励交流 2010-08-03 12:04:19
哦，就知道质粒，细胞器，病毒基因组有环形的，细菌基因组那得多大一个环啊

既然是环形那就无所谓谁第一了

找到ori复制起点就可以了

fasta格式本身就是人为规定的
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6楼2010-08-03 09:56:18
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zhaohq1209

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引用回帖:
Originally posted by mybeerbear at 2010-08-03 08:43:05:

你确定吗？那线粒体基因组呢？如果测序未拼接出起始区呢？

LZ的是线粒体基因组？
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7楼2010-08-03 11:56:35
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mybeerbear

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zhaohq1209 at 2010-08-03 11:56:35:

LZ的是线粒体基因组？

不是，是细菌基因组。
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8楼2010-08-03 19:26:16
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