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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】计算时分子结构被破坏
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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henuhaog

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】计算时分子结构被破坏 已有5人参与

I want to optimize the geometry  of Dithiobis succinimidyl propionate (DTSP) with B3LYP.
I used Gaussianview to construct DTSP without any restriction. However, the C-O bond broke and two head groups(C4H4NO3-, ) came together during optimization. The structure is totally changed. At last, the calculation died at link 9999. What should I do if I want to avoid this?
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1楼 2010-07-27 22:16:51
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
★
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There are some mistakes for many people  that they constructed initial molecule geometry wihtout  checking the rationality which results the wrong phenomena as LZ
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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
6楼2010-07-30 12:07:18
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cailianguo

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也碰到这样的问题，不知道怎么弄的
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蔡老师化工模拟aspenplus裙283978852
2楼2010-07-28 09:27:09
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springxa

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
是否有减少优化步长的参数，可以试试
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4楼2010-07-28 10:17:45
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半支烟5591

银虫 (正式写手)

专家
★
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The initial structure is not reasonable or it is completely wrong,
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5楼2010-07-29 13:33:28
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