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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】咨询有关生物信息学的问题
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xiaohuannu

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】咨询有关生物信息学的问题 已有4人参与

各位大侠 最近遇到了一个问题 请大家帮忙解决一下：
    我手头有一个核苷酸/蛋白的序列，我想知道在一个已经基因组测序的菌株（此菌株并没有注释出含有我的这个序列）基因组中是否含有我这个序列，应该怎么做呢？用什么软件呢？  
先谢谢大家了
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1楼 2010-07-21 20:45:20
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xiaohuannu

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhaohq1209 at 2010-07-21 21:15:30:
BLAST

是这样的 我已经拿到了全基因组和我的基因序列 怎么比对呢  
还想知道我的序列如果在基因组中存在，在他的什么位置
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5楼2010-07-22 09:07:31
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xiaohuannu

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 天使托 at 2010-07-21 21:44:26:
可以blast一下！

是这样的 我已经拿到了全基因组和我的基因序列 怎么比对呢
赞一下 回复此楼
4楼2010-07-22 09:06:13
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glidingwater

银虫 (小有名气)
xiaohuannu(金币+2):谢谢 我试试 2010-07-23 14:11:30
用DNASTAR来搜索一下即可，
前提下载该菌的基因组
赞一下 回复此楼
如果社会的黑暗侵蚀了学府，我该往何处？
6楼2010-07-23 09:55:22
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