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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】电泳中bp估算（初学者）
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痴书小孩

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】电泳中bp估算（初学者） 已有4人参与

我在跑dna双链电泳中条带在750bp的位置，请问这表示有dna双链有750对碱基吗，也就是说双链共有1500个碱基，是不是这么算的要乘二的，如果是单链dna呢，就是表示共有750个碱基吗，如果我不知道是双链还是单链，不是没辙了?不知道我哪里想错了，指教了
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1楼 2010-07-14 13:30:07
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lhm_hnyj

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
看来咱是一个级别的呀
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2楼2010-07-14 14:30:57
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+2): 2010-07-14 20:42:57
bp = base pair
你说呢？

单链一般用nt（nucleotide）或者mer（用于描述短链）

单链DNA不适合用双链DNA的marker做参比，因为单链的泳动速度不仅取决于分子量，构象的影响也很大~~~
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3楼2010-07-14 15:06:44
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cheo163

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
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amisking(金币+2):欢迎交流！ 2010-07-14 20:43:20
同意楼上的观点。
DNA分子处于不同构象时,它在电场中移动距离不仅和分子量有关,还和它本身构象有关。相同分子量的线状、开环和超螺旋DNA在琼脂糖凝胶中移动速度是不一样的,超螺旋DNA移动最快,而开环双链DNA移动最慢。
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4楼2010-07-14 15:10:32
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痴书小孩

铁杆木虫 (小有名气)
问题是貌似我看到的Marker的单位都是bp呀，还有如果我不知道单链还是双链怎么办呢，貌似我看到有的文章就是通过跑电泳确定核酸大小的，是不是他们都预先知道单双链呢
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5楼2010-07-14 20:36:14
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★
reasonspare(金币+1):谢谢分享。 2010-07-15 04:04:45
引用回帖:
Originally posted by 痴书小孩 at 2010-07-14 20:36:14:
问题是貌似我看到的Marker的单位都是bp呀，还有如果我不知道单链还是双链怎么办呢，貌似我看到有的文章就是通过跑电泳确定核酸大小的，是不是他们都预先知道单双链呢

是的，基本上都是双链，提取的基因组、PCR产物、酶切产物等都是dsDNA
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6楼2010-07-14 23:42:09
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痴书小孩

铁杆木虫 (小有名气)
那么如何确定单双链呢，比如说病毒RNA，既有单链的，也有双链的呀
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7楼2010-07-15 09:32:22
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
RecJ 核酸外切酶

RecJf 作用于单链 DNA，沿 5' →3' 方向催化去除单磷酸脱氧核苷酸（1）。RecJf 与麦芽糖结合蛋白（MBP）融合表达。其催化特性与野生型 RecJ 相同。与MBP的融合，增强了 RecJf 的溶解度。

当底物为 5' 端突出了 22 个核苷酸的 DNA 时，经 RecJf 酶切后可得到含有以下三种末端的混合产物：平齐末端；5' 突出末端（1-5 个核苷酸）；5' 凹陷末端（1-8个核苷酸）。RecJf 发挥活性时无需 5' 末端磷酸化。

http://www.neb-china.com/product ... e1=003&cpxh=502
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8楼2010-07-15 10:39:32
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