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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助成功】帮忙编个进行多任务计算小程序
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wo8165827

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助成功】帮忙编个进行多任务计算小程序 已有2人参与

帮忙编个程序：

要求：有好几个VASP任务要计算。如/home/1, /home/2 /home/3。当计算完任务1时，计算机自动开始计算2，当2计算完时自动开始计算3。


Linux命令不熟，谢谢各位了。

[ Last edited by wo8165827 on 2010-7-9 at 10:06 ]
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计算的魅力
1楼 2010-07-08 10:19:47
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
★
wo8165827(金币+8):谢谢 2010-07-08 10:28:31
lvjian8596(金币+1):感谢交流！ 2010-07-08 10:31:59
这个很简单啊
比如有1 2 3三个目录，那么弄好输入后。写个脚本。
#!/bin/sh
cd 1
mpirun -np n vasp
cd ../2
mpirun -np n vasp
cd ../3
mpirun -np n vasp
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2楼2010-07-08 10:26:04
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wo8165827

金虫 (小有名气)
那程序会识别VASP任务计算完了吗？
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计算的魅力
3楼2010-07-08 10:28:17
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
★
wo8165827(金币+7):我先试试。谢谢了 2010-07-08 10:34:43
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-07-08 11:20:01
引用回帖:
Originally posted by wo8165827 at 2010-07-08 10:28:17:
那程序会识别VASP任务计算完了吗？

linux系统脚本默认在一行命令退出后才会执行下一行命令。
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4楼2010-07-08 10:32:52
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wo8165827

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 锐利的碎片 at 2010-07-08 10:26:04:
这个很简单啊
比如有1 2 3三个目录，那么弄好输入后。写个脚本。
#!/bin/sh
cd 1
mpirun -np n vasp
cd ../2
mpirun -np n vasp
cd ../3
mpirun -np n vasp

它会自动识别计算完成了吗？然后才执行下一个任务。。
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计算的魅力
5楼2010-07-08 10:34:18
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by wo8165827 at 2010-07-08 10:34:18:



它会自动识别计算完成了吗？然后才执行下一个任务。。

当然
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6楼2010-07-08 10:35:20
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wo8165827

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 锐利的碎片 at 2010-07-08 10:35:20:

当然

我刚试了下，不行哦。是不是命令不完整呢？要怎么运行？我刚刚建了一个run的文件，后来运行了./run，就提示错误了。谢谢
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计算的魅力
7楼2010-07-08 10:49:25
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):谢谢提示！ 2010-07-08 11:20:14
zzy870720z(金币+1):谢谢说明 2010-07-08 11:22:47
引用回帖:
Originally posted by wo8165827 at 2010-07-08 10:49:25:


我刚试了下，不行哦。是不是命令不完整呢？要怎么运行？我刚刚建了一个run的文件，后来运行了./run，就提示错误了。谢谢

那只是个例子，有些还是要自己改。比如mpi那行要根据cpu数量改下，如果是mpich2要在最前面加上mpd&。最后的run用chmod +x 改成可执行。具体自己看实际情况了。
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8楼2010-07-08 11:00:20
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wo8165827

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 锐利的碎片 at 2010-07-08 11:00:20:

那只是个例子，有些还是要自己改。比如mpi那行要根据cpu数量改下，如果是mpich2要在最前面加上mpd&。最后的run用chmod +x 改成可执行。具体自己看实际情况了。

不好意思，我自己不懂这个，我的机子是双核的。你可以帮我把最终可以运行帮忙下写下吗？还有就是怎么运行。谢谢，好了，给加分。。。
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计算的魅力
9楼2010-07-08 11:06:49
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
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gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-07-08 11:20:26
引用回帖:
Originally posted by wo8165827 at 2010-07-08 11:06:49:



不好意思，我自己不懂这个，我的机子是双核的。你可以帮我把最终可以运行帮忙下写下吗？还有就是怎么运行。谢谢，好了，给加分。。。

那编译的的是不是并行的，mpi装的什么，还有几个文件夹名字，vasp的位置总得告诉我吧。
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10楼2010-07-08 11:09:40
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