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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】transiesta中关于轨道的问题
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zhangguangping

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】transiesta中关于轨道的问题 已有4人参与

使用transiesta的虫友们
想请教一个问题：在做输运计算的时候，问什么有些文章该给出了某些分子轨道的分布图形。在输运体系中不是已经没有轨道可言了吗？
我想知道给出的那些轨道是怎么计算出来的。
有些文章是用transiesta做的，也画出了相应的HOMO，LUMO等分子轨道。
如果是在transiesta就算的时候产生的那个WFSX文件产生的话，那么那个文件应该是在transiesta计算开始还没有进行格林函数和电子密度进行自洽之前产生的，这个时候的电子密度不能正确反映输运时候的电子密度分布情况吧！
请高手指教一下！
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弘德明志博学笃行
1楼 2010-07-06 10:21:39
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redhaier

金虫 (小有名气)
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cenwanglai(金币+2):谢谢回复! 2010-07-06 17:02:01
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Originally posted by zhangguangping at 2010-07-06 10:21:39:
使用transiesta的虫友们
想请教一个问题：在做输运计算的时候，问什么有些文章该给出了某些分子轨道的分布图形。在输运体系中不是已经没有轨道可言了吗？
我想知道给出的那些轨道是怎么计算出来的。
有些文章是 ...

这个HOMO（LUMO）是投影的， 他们管它叫projected self-consistent Hamiltonian（MPSH），就是用输运自洽的波函数投影到孤立体系求得的HOMO（LUMO）轨道中，当和电极的耦合可以看做微扰的时候，这个做法是可行的。
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2楼2010-07-06 16:56:16
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
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Originally posted by redhaier at 2010-07-06 09:56:16:



这个HOMO（LUMO）是投影的， 他们管它叫projected self-consistent Hamiltonian（MPSH），就是用输运自洽的波函数投影到孤立体系求得的HOMO（LUMO）轨道中，当和电极的耦合可以看做微扰的时候，这个做法是可 ...

对于这个投影具体怎么做，我不是很清楚。我能不能对输运得到的体系的电荷密度用对角化的方法对这个电荷密度得到的哈密顿，来得到一套体系的分子轨道，这套分子轨道有意义吗？
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弘德明志博学笃行
3楼2010-07-06 19:33:21
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redhaier

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lvjian8596(金币+1):感谢交流！ 2010-07-06 23:07:20
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Originally posted by zhangguangping at 2010-07-06 19:33:21:

对于这个投影具体怎么做，我不是很清楚。我能不能对输运得到的体系的电荷密度用对角化的方法对这个电荷密度得到的哈密顿，来得到一套体系的分子轨道，这套分子轨道有意义吗？

对输运自洽的Hamiltonian对角化没有意义，毕竟不是闭合的体系。
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4楼2010-07-06 20:04:53
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
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Originally posted by redhaier at 2010-07-06 13:04:53:


对输运自洽的Hamiltonian对角化没有意义，毕竟不是闭合的体系。

虽然不是闭合体系，但是已经把无限大的电极对中间扩展分子部分的影响已经考虑到哈密顿中了，所以在计算的过程中实际上和计算孤立体系没什么两样。现在已经得到扩展分子部分自洽的电子密度了，用这个电子密度去计算扩展分子部分的哈密顿，这个哈密顿已经包含了电极的影响了，对这个哈密顿进行对角化得到的轨道波函数，可以近似的表示体系一些性质吧！
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弘德明志博学笃行
5楼2010-07-06 20:28:30
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redhaier

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Originally posted by zhangguangping at 2010-07-06 20:28:30:

虽然不是闭合体系，但是已经把无限大的电极对中间扩展分子部分的影响已经考虑到哈密顿中了，所以在计算的过程中实际上和计算孤立体系没什么两样。现在已经得到扩展分子部分自洽的电子密度了，用这个电子密度去计 ...

我不知道一个开放体系为什么可以通过对角化来给出电子占据的状况。
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6楼2010-07-06 20:37:09
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
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Originally posted by redhaier at 2010-07-06 13:37:09:


我不知道一个开放体系为什么可以通过对角化来给出电子占据的状况。

可能我的想法不对，呵呵呵！见笑了！我认为开放体系身也没有什么轨道可言。轨道不都是对角化的本征向量吗？投影到孤立的分子上，也是一种近嘛！好像那样做更专业一点！但是我不是很清楚具体怎么投影。能否给我讲解一下，或者推荐一个有关的文献！谢谢了！
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弘德明志博学笃行
7楼2010-07-06 21:43:13
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
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Originally posted by redhaier at 2010-07-06 13:37:09:


我不知道一个开放体系为什么可以通过对角化来给出电子占据的状况。

另外，如果我做不出投影轨道的话，是不是我用体系的态密度也可以说明问题啊！根据输运体系的态密度看一看出一个一个展宽的峰，一个峰就对应原来分子体系的一个轨道本征值。如果我选取峰附近的一个能量范围画出这个能量范围的态密度在空间的分布应该和画轨道有相似的效果吧？
谢谢指点！
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弘德明志博学笃行
8楼2010-07-06 21:52:48
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redhaier

金虫 (小有名气)
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Originally posted by zhangguangping at 2010-07-06 21:52:48:

另外，如果我做不出投影轨道的话，是不是我用体系的态密度也可以说明问题啊！根据输运体系的态密度看一看出一个一个展宽的峰，一个峰就对应原来分子体系的一个轨道本征值。如果我选取峰附近的一个能量范围画出这 ...

你给个邮箱，我给你传文献，是侯士敏老师的学生李锐的博士论文，里面有详细的介绍，另外你说的投影态密度的做法，我觉得可行。
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9楼2010-07-07 00:40:07
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wei.ji

木虫 (正式写手)
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你最近很清闲呀，来之前不准备回国一趟？
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Originally posted by redhaier at 2010-07-07 00:40:07:



你给个邮箱，我给你传文献，是侯士敏老师的学生李锐的博士论文，里面有详细的介绍，另外你说的投影态密度的做法，我觉得可行。

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http://sim.phys.ruc.edu.cn
10楼2010-07-07 01:01:26
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