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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】关与2A类错误 short Inter
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yanli2820

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关与2A类错误 short Inter 已有5人参与

我作的是金属有机配合物 其中结构中有游离的水 加完H后出现以下四个A类错误 请求帮忙解决！

PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X       H1A    ..  H14C    ..       1.87 Ang.
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H10B   ..  H16C    ..       1.65 Ang.
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H13C   ..  H15A    ..       1.54 Ang.
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H13E   ..  H15A    ..       1.72 Ang.
其中H1A是C上的H 其余的都是游离的水分子上的H
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1楼 2010-07-01 10:23:15
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hao_jian

木虫 (正式写手)
★ ★
yanli2820(金币+1):谢谢参与
wsht212(金币+1):谢谢交流，希望常来！ 2010-07-01 21:56:05
yanli2820(金币+2): 2010-07-02 08:19:03
是你水上加H加错了，这个应该根据氢键关系重新安排各个H
游离水有时候可以不加H，这样省事
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2楼2010-07-01 13:25:05
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日不落

金虫 (著名写手)
★
yanli2820(金币+1):谢谢参与
wsht212:谢谢交流，希望常来！ 2010-07-01 21:56:14
yanli2820(金币+1): 2010-07-02 08:19:11
引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-07-01 13:25:05:
是你水上加H加错了，这个应该根据氢键关系重新安排各个H
游离水有时候可以不加H，这样省事

游离水不加氢，不会影响R1、wR2值吗？
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-07-01 13:56:54
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hao_jian

木虫 (正式写手)
wsht212:谢谢交流，希望常来！ 2010-07-01 21:56:21
yanli2820(金币+1): 2010-07-02 08:19:36
影响不大，至少比加错要好
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4楼2010-07-01 14:01:56
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gzg

木虫 (著名写手)
★
yanli2820(金币+1):谢谢参与
wsht212:谢谢交流，希望常来！ 2010-07-01 21:56:29
yanli2820(金币+2): 2010-07-02 08:18:49
yanli2820(金币+1): 2010-07-02 08:19:40
可以限制一下键长。
赞一下(2人) 回复此楼
简单做人，用心做事---今天不能和昨天一样！
5楼2010-07-01 15:12:47
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yanli2820

木虫 (正式写手)
yanhualover:谢谢交流 2010-07-02 08:30:56
如果不加 CIF会显示水上的H缺失
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6楼2010-07-02 08:20:30
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日不落

金虫 (著名写手)
yanhualover:谢谢交流 2010-07-02 08:31:01
yanli2820(金币+1): 2010-07-02 09:19:15
引用回帖:
Originally posted by yanli2820 at 2010-07-02 08:20:30:
如果不加 CIF会显示水上的H缺失

是啊，为了找到相应的Q值命名为H，将PLAN数据加大，增加了好多Ｑ值，看得眼睛都花了。
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7楼2010-07-02 08:25:09
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yanli2820

木虫 (正式写手)
请问如何限制—OH羟基H的键长啊
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8楼2010-07-02 09:21:17
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hao_jian

木虫 (正式写手)
yunruirui:谢谢交流 2010-07-02 10:30:55
yanli2820(金币+1): 2010-07-02 12:10:52
引用回帖:
Originally posted by yanli2820 at 2010-07-02 09:21:17:
请问如何限制—OH羟基H的键长啊

dfix就可，如dfix 0.95 O1 H1a
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9楼2010-07-02 10:09:24
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sunlin_362

银虫 (小有名气)
★
yanli2820(金币+1):谢谢参与
帝夫:感谢您的回帖交流！ 2010-10-05 13:01:07
引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-07-01 13:25:05:
是你水上加H加错了，这个应该根据氢键关系重新安排各个H
游离水有时候可以不加H，这样省事

但是游离水不加氢则OW无序，加氢则总有short inter D-A H1w.....H1w    这应该怎么处理呢？麻烦指点下，急急急！！！！谢谢谢谢！！！！
赞一下(3人) 回复此楼
10楼2010-10-04 17:30:14
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