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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】势能曲线扫描
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xiaowu787

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】势能曲线扫描 已有4人参与

刚接触Gaussian,我想扫描Al-H键之间的解离曲线AlH3--AlH2+H
下面是GView做的输入文件，想修改键长变量，不知该怎么修改？请大家帮忙。
顺便问一下，扫描势能曲线有哪些问题需要注意？谢谢
# opt=modredundant rmp2/6-311++g test

AlOscan

0 1
Al                 0.00000000    0.00000000    0.00000000
H                  0.00000000    1.60856400    0.00000000
H                  1.39305700   -0.80428200    0.00000000
H                 -1.39305700   -0.80428200    0.00000000

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0
2
3
4

[ Last edited by xiaowu787 on 2010-6-24 at 20:54 ]
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1楼 2010-06-24 20:42:39
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tjuZidan

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
xiaowu787(金币+1): 2010-06-24 21:35:21
heyo_123(金币+1):鼓励应助 ！！ 2010-06-25 08:09:23
M(Al) N(H) R1(value) S(scan) nsteps stepsize
赞一下(2人) 回复此楼
别以后想起又是遗憾
2楼2010-06-24 21:14:24
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tjuZidan at 2010-06-24 21:14:24:
M(Al) N(H) R1(value) S(scan) nsteps stepsize

%chk=D:\g09w\help\ALOscan.chk
#t scan rmp2/6-311++g test

AlOscan

0 1
Al                 0.00000000    0.00000000    0.00000000
H                  0.00000000    1.60856400    0.00000000
H                  1.39305700   -0.80428200    0.00000000
H                 -1.39305700   -0.80428200    0.00000000

1 2 r
1 3 1.0
1 4 1.0
2
3
4

r 0.8 S 80 0.05

出错提示： A scan must involve at least one variable
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-24 21:33:38
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forestwolf9291

木虫 (著名写手)
★ ★
xiaowu787(金币+1):谢谢参与
xiaowu787(金币+1):谢谢 2010-06-24 21:35:52
heyo_123(金币+1):鼓励应助 ！！ 2010-06-25 08:09:38
最好不用直角坐标
引用回帖:
Originally posted by xiaowu787 at 2010-06-24 20:42:39:
刚接触Gaussian,我想扫描Al-H键之间的解离曲线AlH3--AlH2+H
下面是GView做的输入文件，想修改键长变量，不知该怎么修改？请大家帮忙。
顺便问一下，扫描势能曲线有哪些问题需要注意？谢谢
# opt=modredundant  ...

赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-06-24 21:34:09
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by forestwolf9291 at 2010-06-24 21:34:09:
最好不用直角坐标

帮忙分析一下上面的错误，不用直角坐标，用分数坐标吗？
赞一下 回复此楼
5楼2010-06-24 21:37:54
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tjuZidan

木虫 (小有名气)
★
heyo_123(金币+1):鼓励应助！！！ 2010-06-25 09:31:52
xiaowu787(金币+1): 2010-06-25 09:45:17
用内坐标，在用GV保存输入文件的时候把Write Cartesians选项勾掉就可以了
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别以后想起又是遗憾
6楼2010-06-25 08:57:05
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tjuZidan at 2010-06-25 08:57:05:
用内坐标，在用GV保存输入文件的时候把Write Cartesians选项勾掉就可以了

%chk=D:\g09w\help\ALOscan3.chk
# scan rmp2/6-311++g geom=connectivity test

AlOscan

0 1
Al            
H                  1    r
H                  1    1.60856375    2  120.00000512
H                  1    1.60856375    3  119.99998976    2  180.00000000    0

r 0.90 200 0.05

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0
2
3
4

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0
1.0是什么意思呢，Al-H之间的距离是1.60的
赞一下 回复此楼
7楼2010-06-25 10:11:04
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tjuZidan

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
xiaowu787(金币+2):thanks!! 2010-06-25 11:21:20
去看Geom关键词的connectivity选项吧，你想知道的1.0是什么意思就在那里！



Loading。。。。。










当你看完以后你会发现，2、 3、 4号原子分别与1号原子相连，并且是单键！
如果是双键，这个值就是2.0，以此类推，当然还有0.5
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别以后想起又是遗憾
8楼2010-06-25 10:29:31
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xiaowu787

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tjuZidan at 2010-06-25 10:29:31:
去看Geom关键词的connectivity选项吧，你想知道的1.0是什么意思就在那里！



Loading。。。。。










当你看完以后你会发现，2、 3、 4号原子分别与1号原子相连，并且是单键！
如果是双键， ...

非常感谢，原来此数值是两个成键原子之间的键级。
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9楼2010-06-25 11:28:47
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ter20

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
xiaowu787(金币+1):谢谢参与
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-06-27 15:04:24
可以尝试用柔性扫描（平缓势能面扫描），关键字指定：Opt=Z-matrix，用内坐标，在坐标结束后空一行，加上R1  0.9  S  5  0.05(只是举个例子，具体的键长及步长楼主可自己设)
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10楼2010-06-26 09:54:47
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