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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】关于TD-DFT模拟Uv-Vis光谱的问题
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 风雪江山乱 at 2010-06-21 21:27:04:

我就是用wizard 处理得到的*.dat文件用origin做的图，得到的数据就没有f 这一栏啊，是不是swizard 设置问题？

你需要自己把 f 加进去啊……
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21楼2010-06-21 22:37:55
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
风雪江山乱(金币+2):学习了 果然是 2010-06-22 10:06:05
aylayl08(金币+1): 2010-07-14 09:24:55
引用回帖:
Originally posted by 风雪江山乱 at 2010-06-21 09:35:25:




Excited State   2:   Singlet-A      2.7300 eV  454.15 nm  f=0.0312
     172 ->173         0.42467
     172 ->174        -0.30717
     172 ->176         0.41066
     172 ->17 ...

现在我知道如何计算 172 -> 173 的百分数了，呵呵……

0.42467^2 / 0.5 = 36.07%

即 expand coefficients 的平方除以 0.5
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22楼2010-06-21 23:09:36
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
另外，这个数值 swizard 也可以给出，在 swizard.txt 中……
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23楼2010-06-21 23:10:42
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风雪江山乱

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2010-06-21 22:37:55:


你需要自己把 f 加进去啊……

现在的问题是我想做出

这种图，哪怕不值双坐标，只有f 值也行，但是swizard 处理出来的*.dat里没有f这一栏，要是按不同跃迁能下的 f 值手工加入的话，f 点连接起来应该和模拟出的光谱差别很大吧。
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24楼2010-06-22 10:12:34
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by 风雪江山乱 at 2010-06-22 10:12:34:


现在的问题是我想做出

这种图，哪怕不值双坐标，只有f 值也行，但是swizard 处理出来的*.dat里没有f这一栏，要是按不同跃迁能下的 f  ...

.dat 中是波长与吸光度/消光系数
.txt 中有波长和 f 值

你把这两组数据绘到一个图上就可以了啊……

你等会儿，我上个图给你看看，呵呵……
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25楼2010-06-22 10:14:25
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★
风雪江山乱(金币+2):感谢热心帮助 2010-06-22 10:58:19
aylayl08(金币+1):谢谢帮忙 2010-07-14 09:25:11
可以看看我画的图：



改变了一下坐标范围之后的



[ Last edited by snoopyzhao on 2010-6-22 at 10:57 ]
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26楼2010-06-22 10:41:21
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风雪江山乱

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2010-06-22 10:41:21:
可以看看我画的图：


就是要这样的图 请问具体是怎么做出来的啊？
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27楼2010-06-22 10:55:10
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by 风雪江山乱 at 2010-06-22 10:55:10:

就是要这样的图 请问具体是怎么做出来的啊？

我用的是 R，下面是数据和代码，你自己看吧……
CODE:
> zz
    wave      f
1  262.2 0.0000
2  140.4 0.0273
3  130.2 0.0555
4  125.3 0.1722
5  121.3 0.0005
6  120.9 0.1503
7  120.1 0.0000
8  105.6 0.0000
9  105.5 0.1040
10  98.5 0.0127
> z[,c(2,3)]
      wave            a
1   190.48 2.522337e-44
2   190.11 8.127531e-44
3   189.75 2.550363e-43
4   189.39 7.973388e-43
5   189.04 2.471890e-42
6   188.68 7.618860e-42
7   188.32 2.333863e-41
8   187.97 7.105424e-41
9   187.62 2.149998e-40
10  187.27 6.465577e-40
11  186.92 1.932419e-39
12  186.57 5.740095e-39
13  186.22 1.694576e-38
14  185.87 4.971955e-38
15  185.53 1.449832e-37
16  185.19 4.201768e-37
17  184.84 1.210238e-36
18  184.50 3.464445e-36
19  184.16 9.856454e-36
20  183.82 2.786968e-35
...................................
660  84.46 1.223506e-35
661  84.39 4.325589e-36
662  84.32 1.519877e-36
663  84.25 5.307574e-37
664  84.18 1.842077e-37
665  84.10 6.353948e-38
666  84.03 2.178230e-38
667  83.96 7.421436e-39
668  83.89 2.513023e-39
669  83.82 8.457243e-40
670  83.75 2.828689e-40
671  83.68 9.402993e-41
672  83.61 3.106539e-41
673  83.54 1.020005e-41
674  83.47 3.328084e-42
675  83.40 1.079000e-42
676  83.33 3.475220e-43
677  83.26 1.121039e-43
678  83.19 3.503246e-44
679  83.13 1.121039e-44
> png("zz.png")
> plot(z[,c(2,3)], xlim = c(90,150),type = "l", ylab = "", yaxt = "n")
> par(new=TRUE)
> plot(zz,xlim = c(90,150), ylim =c(0.0,0.22), type = "h", col = "gray", xlab = "", ylab = "f", xaxt = "n")
> points(zz, pch = 19, col = 2)
> dev.off()
windows
      2
>

[ Last edited by snoopyzhao on 2010-6-22 at 11:07 ]
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28楼2010-06-22 11:03:50
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★
aylayl08(金币+1): 2010-07-14 09:25:22
以 > 开头的是命令。数据由于大小限制，删了一些……

看一个想法即可，不同的软件有不同的做法，呵呵……
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29楼2010-06-22 11:04:41
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风雪江山乱

铜虫 (小有名气)
天啊
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30楼2010-06-22 11:21:09
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