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风雪江山乱

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于TD-DFT模拟Uv-Vis光谱的问题 已有16人参与

第一次做,遇到很多问题需要向各位请教,请各位不辞劳烦,不吝赐教:
1。关于out文件作图的问题

请问这个图是用什么软件做的,作图时如何忽略f<0.08的跃迁。并将光谱和f值同时做出来?
2。

此表中的跃迁百分比是如何得到的?如426 nm的H-2到L+1的跃迁为49%
3。out文件跃迁信息的各部分是什么含义
Excited State   2:   Singlet-A      2.7300 eV  454.15 nm  f=0.0312
     172 ->173         0.42467
     172 ->174        -0.30717
     172 ->176         0.41066
     172 ->177        -0.12732
     172 ->179        -0.11427

请各位赐教
谢谢
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by 风雪江山乱 at 2010-06-22 10:55:10:

就是要这样的图 请问具体是怎么做出来的啊?

我用的是 R,下面是数据和代码,你自己看吧……
CODE:
> zz
    wave      f
1  262.2 0.0000
2  140.4 0.0273
3  130.2 0.0555
4  125.3 0.1722
5  121.3 0.0005
6  120.9 0.1503
7  120.1 0.0000
8  105.6 0.0000
9  105.5 0.1040
10  98.5 0.0127
> z[,c(2,3)]
      wave            a
1   190.48 2.522337e-44
2   190.11 8.127531e-44
3   189.75 2.550363e-43
4   189.39 7.973388e-43
5   189.04 2.471890e-42
6   188.68 7.618860e-42
7   188.32 2.333863e-41
8   187.97 7.105424e-41
9   187.62 2.149998e-40
10  187.27 6.465577e-40
11  186.92 1.932419e-39
12  186.57 5.740095e-39
13  186.22 1.694576e-38
14  185.87 4.971955e-38
15  185.53 1.449832e-37
16  185.19 4.201768e-37
17  184.84 1.210238e-36
18  184.50 3.464445e-36
19  184.16 9.856454e-36
20  183.82 2.786968e-35
...................................
660  84.46 1.223506e-35
661  84.39 4.325589e-36
662  84.32 1.519877e-36
663  84.25 5.307574e-37
664  84.18 1.842077e-37
665  84.10 6.353948e-38
666  84.03 2.178230e-38
667  83.96 7.421436e-39
668  83.89 2.513023e-39
669  83.82 8.457243e-40
670  83.75 2.828689e-40
671  83.68 9.402993e-41
672  83.61 3.106539e-41
673  83.54 1.020005e-41
674  83.47 3.328084e-42
675  83.40 1.079000e-42
676  83.33 3.475220e-43
677  83.26 1.121039e-43
678  83.19 3.503246e-44
679  83.13 1.121039e-44
> png("zz.png")
> plot(z[,c(2,3)], xlim = c(90,150),type = "l", ylab = "", yaxt = "n")
> par(new=TRUE)
> plot(zz,xlim = c(90,150), ylim =c(0.0,0.22), type = "h", col = "gray", xlab = "", ylab = "f", xaxt = "n")
> points(zz, pch = 19, col = 2)
> dev.off()
windows
      2
>

[ Last edited by snoopyzhao on 2010-6-22 at 11:07 ]
28楼2010-06-22 11:03:50
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查看全部 46 个回答

abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西


heyo_123(金币+1):鼓励交流!! 2010-06-21 08:36:35
风雪江山乱(金币+1):xiexie 2010-06-21 09:29:36
通讯作者是干嘛的?
邮件或者电话咨询?
如果对方说不上, 写文章comment. 骂他造假!
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
2楼2010-06-20 23:17:29
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)


heyo_123(金币+1):鼓励交流!! 2010-06-21 08:36:41
风雪江山乱(金币+2):谢谢 2010-06-21 09:26:20
第 1 个问题,可以使用 swizard 得到那个曲线的数据,那个点的数据就是 f,画图用任何软件都可以……

第二个问题,根据第三个问题的激发态波函数的系数计算得到的

第三个问题: 172->173 表示从分子轨道  172 向 173 跃迁, 0.42467 表示每个激发态波函数的系数

大概就是这个样子,其实多看一下 gaussian 的说明文档就有了
3楼2010-06-21 08:20:30
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gyli

木虫 (小有名气)

~~~~

★ ★
erylingjet(金币+2):感谢交流! 2010-06-21 09:02:35
风雪江山乱(金币+1):谢谢 2010-06-21 09:28:30
引用回帖:
Originally posted by abbott at 2010-06-20 23:17:29:
通讯作者是干嘛的?
邮件或者电话咨询?
如果对方说不上, 写文章comment. 骂他造假!

补充一下楼上的:

GaussView可以直接做出这个图,若嫌不好看将数据导出即可。
Gravitation cannot be held responsible for people falling in love.
4楼2010-06-21 08:38:32
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