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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】求助： its鉴定序列分析
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幽幽之兰

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】求助： its鉴定序列分析 已有2人参与

大家好。我最近在做真菌its，用的是真菌DNA的pcr产物测序，测的2个反应，得到的拼接序列是否为全序列？直接比对就可以了吗？需要找模式菌种不？热切真诚的希望有高人指点一下，新手Sample Text上路，还得多多向你们学习呀。万分感谢.......
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1楼 2010-06-14 00:49:10
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bchen

木虫 (正式写手)
不好意思，不太懂，
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2楼2010-06-14 01:17:56
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欣晴5832

金虫 (小有名气)
★ ★
1949stone(金币+2):谢谢交流 2010-06-14 13:15:01
幽幽之兰(金币+1):谢谢啊 2010-06-15 00:24:05
真菌ITS序列通常都有多长，长度保守吗？你把得到的拼接序列先blast一下，看看比对结果，如果搜到其他的序列，再看看人家的，确定边界后从你自己的序列中找，就知道是不是全序列了（用软件）。
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3楼2010-06-14 10:27:27
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