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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】Dmol能否对结构固定的团簇计算性质
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shengfengyu

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Dmol能否对结构固定的团簇计算性质 已有5人参与

用Dmol能否对一个结构固定的团簇，也就是不进行结构优化，但是计算其性质，大家有没有看过类似的文章，有的话给小虫推荐几篇~谢谢啦

[ Last edited by shengfengyu on 2010-6-3 at 09:46 ]
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1楼 2010-06-03 09:43:34
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)
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zzy870720z(金币+1):谢谢 2010-06-03 13:02:03
可以直接计算性质，优化能量就好了，但是所有的文章都应该是自己将对象结构进行了几何优化才能确定的，不优化结构似乎不太合理。
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博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
2楼2010-06-03 11:05:17
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shengfengyu

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ym23 at 2010-06-03 11:05:17:
可以直接计算性质，优化能量就好了，但是所有的文章都应该是自己将对象结构进行了几何优化才能确定的，不优化结构似乎不太合理。

我用别的软件优化好了的结构，想放在Dmol下面计算其性质，所以要固定其坐标，不知道这样的做法何不合理
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3楼2010-06-03 12:17:07
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)
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引用回帖:
Originally posted by shengfengyu at 2010-06-03 12:17:07:

我用别的软件优化好了的结构，想放在Dmol下面计算其性质，所以要固定其坐标，不知道这样的做法何不合理

这个是合理的，因为任何一个工具的功能都是有限的，所以广泛使用工具是好事。
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博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
4楼2010-06-03 20:32:55
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liujuan8704

银虫 (小有名气)
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能量优化不会在把坐标改变么？
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5楼2010-10-18 10:18:42
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王小一

金虫 (小有名气)
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引用回帖:
Originally posted by liujuan8704 at 2010-10-18 10:18:42:
能量优化不会在把坐标改变么？

会改变的呀，但是不会太大，是寻找能量最低那一点的构型
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6楼2010-10-18 14:31:57
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liujuan8704

银虫 (小有名气)
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[quote]Originally posted by shengfengyu at 2010-06-03 09:43:34:
用Dmol能否对一个结构固定的团簇，也就是不进行结构优化，但是计算其性质，大家有没有看过类似的文章，有的话给小虫推荐几篇~谢谢啦

[ Last edited by shengfengyu on 2010-6-3 at 09:46 ] [/quote
就是会改变坐标啊
那怎么可以在能量优化的基础上计算性质而达到不改变坐标呢？
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7楼2010-10-18 20:21:28
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xiaoqian830606

金虫 (小有名气)
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我想用DMol来模拟一个小分子吸附在分子筛上，固定小分子和分子筛的垂直距离，然后做DMol，计算能量！可是有时候RUN是灰色的，运行不了，不知道原因是什么？有么有可能是因为固定距离后，不能计算能量？不是很明白其中原因。有谁明白的，能否指点一二。
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8楼2010-10-18 21:24:52
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