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[资源] 【coolrainbow个人文集】刚刚编译个NWChem,发个经验吧 已有4人参与

最近要算多组态,可是Gaussian的代码太烂了,Molpro又买不起,决定用NWChem。网上似乎没有什么编译的详细步骤,我摸索了一下,写了这个脚本,根据你自己的集群,修改一些参数,直接在src目录下运行就可以了。
CODE:
#!/bin/csh

# Author: coolrainbow

# This script is used for compiling NWChem

# Basic configuration
# WARNING:Modify the memsize for your own machine!!!

setenv LARGE_FILES TRUE
setenv LIB_DEFINES -DDFLT_TOT_MEM=260609088

# Remote communication
# If you do not use MPICH, comment them, else modify the MPI_LOC for your machine

setenv USE_MPI  y
setenv USE_MPIF y
setenv MPI_LOC  /usr/local/chemsoft/mpich2
setenv MPI_LIB  $MPI_LOC/lib
setenv MPI_INCLUDE  $MPI_LOC/include
setenv LIBMPI       "-lfmpich -lmpich "

# Code tree

setenv NWCHEM_TOP   /home/src4cluster/nwchem-5.1.1

# Platform

setenv NWCHEM_TARGET LINUX64

# Python configuration
# If you do not use PYTHON, comment them.

#setenv PYTHONHOME      /usr
#setenv PYTHONVERSION   2.5

# Blas configuration
# This is related to your own machine. Here I have used MKL Blas. If you do not have any own Blas, comment all

setenv MKLLIB  /opt/intel/Compiler/11.1/069/mkl/lib/em64t
setenv MKLINC  /opt/intel/Compiler/11.1/069/mkl/include
setenv MKLLINK1 "-lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread"
setenv MKLLINK2 " -lmkl_core -lmkl_lapack95_lp64 -liomp5 -lpthread"

setenv BLASOPT  "-L${MKLLIB}    $MKLLINK1 $MKLLINK2 "

# What will be compiled

setenv NWCHEM_MODULES "all"

# Starting...
# Set your own complier

make FC=ifort CC=icc  

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:22 ]
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很好很好
并行得了
2楼2010-06-02 21:23:37
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可惜不是资源帖,上次编译一次
老是出错,最后放弃
参考一下,明天接着试试
谢谢分享
3楼2010-06-02 23:34:26
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yuxuan1976

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
赞cool
4楼2010-06-03 10:54:28
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hairan

木虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
建议版主给设一个QC强贴
5楼2010-06-08 17:04:44
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有话请说

铁虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

我刚准备装的,谢谢楼主的分享!
6楼2010-07-03 15:19:39
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tengh

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主强大,我正在准备安装!
7楼2010-11-02 22:04:25
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sangym

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

太好了!!可以试试!!
8楼2010-11-03 10:25:02
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meixinqing

金虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

lz用的什么平台?我找不到setenv这个命令。。。


$ setenv
-bash: setenv: command not found
9楼2010-12-20 21:28:18
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引用回帖:
Originally posted by meixinqing at 2010-12-20 21:28:18:
lz用的什么平台?我找不到setenv这个命令。。。


$ setenv
-bash: setenv: command not found

setenv是Csh的命令,你得装csh
10楼2010-12-20 22:08:05
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meixinqing

金虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by coolrainbow at 2010-12-20 22:08:05:



setenv是Csh的命令,你得装csh

谢谢
用export貌似得到了一样的效果,正在编译中。。。好像比较慢

下载编译好的貌似也能用,但不知道是不是影响并行计算,自己编译试试。谢谢lz分享
11楼2010-12-20 22:36:05
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jove1782

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

这样看来还是Bash简单

那啥 无聊中 尝试Intel MPI Lib编译中

忽然想换Scientific Linux 没办法垃圾ATI显卡 笔记本真郁闷

coolrainbow是隔壁学校的高人么?
我好想认真学量化啊。。。

其实开始是因为01年开始 我喜欢上了Linux 所以间接想学计算

当年是因为管道太可爱了。。。 So卡哇伊

[ Last edited by jove1782 on 2012-5-28 at 14:51 ]
12楼2012-05-28 14:49:58
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