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【coolrainbow个人文集】刚刚编译个NWChem,发个经验吧
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coolrainbow
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【coolrainbow个人文集】刚刚编译个NWChem,发个经验吧
已有4人参与
最近要算多组态,可是Gaussian的代码太烂了,Molpro又买不起,决定用NWChem。网上似乎没有什么编译的详细步骤,我摸索了一下,写了这个脚本,根据你自己的集群,修改一些参数,直接在src目录下运行就可以了。
CODE:
#!/bin/csh
# Author: coolrainbow
# This script is used for compiling NWChem
# Basic configuration
# WARNING:Modify the memsize for your own machine!!!
setenv LARGE_FILES TRUE
setenv LIB_DEFINES -DDFLT_TOT_MEM=260609088
# Remote communication
# If you do not use MPICH, comment them, else modify the MPI_LOC for your machine
setenv USE_MPI y
setenv USE_MPIF y
setenv MPI_LOC /usr/local/chemsoft/mpich2
setenv MPI_LIB $MPI_LOC/lib
setenv MPI_INCLUDE $MPI_LOC/include
setenv LIBMPI "-lfmpich -lmpich "
# Code tree
setenv NWCHEM_TOP /home/src4cluster/nwchem-5.1.1
# Platform
setenv NWCHEM_TARGET LINUX64
# Python configuration
# If you do not use PYTHON, comment them.
#setenv PYTHONHOME /usr
#setenv PYTHONVERSION 2.5
# Blas configuration
# This is related to your own machine. Here I have used MKL Blas. If you do not have any own Blas, comment all
setenv MKLLIB /opt/intel/Compiler/11.1/069/mkl/lib/em64t
setenv MKLINC /opt/intel/Compiler/11.1/069/mkl/include
setenv MKLLINK1 "-lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread"
setenv MKLLINK2 " -lmkl_core -lmkl_lapack95_lp64 -liomp5 -lpthread"
setenv BLASOPT "-L${MKLLIB} $MKLLINK1 $MKLLINK2 "
# What will be compiled
setenv NWCHEM_MODULES "all"
# Starting...
# Set your own complier
make FC=ifort CC=icc
[
Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:22
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2010-06-02 21:14:44
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2010-06-02 21:23:37
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zzy870720z
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+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
可惜不是资源帖,上次编译一次
老是出错,最后放弃
参考一下,明天接着试试
谢谢分享
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3楼
2010-06-02 23:34:26
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yuxuan1976
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2010-06-03 10:54:28
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2010-06-08 17:04:44
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我刚准备装的,谢谢楼主的分享!
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2010-07-03 15:19:39
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楼主强大,我正在准备安装!
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2010-11-02 22:04:25
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太好了!!可以试试!!
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2010-11-03 10:25:02
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meixinqing
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lz用的什么平台?我找不到setenv这个命令。。。
$ setenv
-bash: setenv: command not found
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9楼
2010-12-20 21:28:18
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coolrainbow
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Originally posted by
meixinqing
at 2010-12-20 21:28:18:
lz用的什么平台?我找不到setenv这个命令。。。
$ setenv
-bash: setenv: command not found
setenv是Csh的命令,你得装csh
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10楼
2010-12-20 22:08:05
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meixinqing
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Originally posted by
coolrainbow
at 2010-12-20 22:08:05:
setenv是Csh的命令,你得装csh
谢谢
用export貌似得到了一样的效果,正在编译中。。。好像比较慢
下载编译好的貌似也能用,但不知道是不是影响并行计算,自己编译试试。谢谢lz分享
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11楼
2010-12-20 22:36:05
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jove1782
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这样看来还是Bash简单
那啥 无聊中 尝试Intel MPI Lib编译中
忽然想换Scientific Linux 没办法垃圾ATI显卡 笔记本真郁闷
coolrainbow是隔壁学校的高人么?
我好想认真学量化啊。。。
其实开始是因为01年开始 我喜欢上了Linux 所以间接想学计算
当年是因为管道太可爱了。。。 So卡哇伊
[
Last edited by jove1782 on 2012-5-28 at 14:51
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12楼
2012-05-28 14:49:58
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