24小时热门版块排行榜    

查看: 2549  |  回复: 11
【奖励】 本帖被评价5次,作者coolrainbow增加金币 4.8
本帖产生 1 个 QC强帖 ,点击这里进行查看

[资源] 【coolrainbow个人文集】刚刚编译个NWChem,发个经验吧 已有4人参与

最近要算多组态,可是Gaussian的代码太烂了,Molpro又买不起,决定用NWChem。网上似乎没有什么编译的详细步骤,我摸索了一下,写了这个脚本,根据你自己的集群,修改一些参数,直接在src目录下运行就可以了。
CODE:
#!/bin/csh

# Author: coolrainbow

# This script is used for compiling NWChem

# Basic configuration
# WARNING:Modify the memsize for your own machine!!!

setenv LARGE_FILES TRUE
setenv LIB_DEFINES -DDFLT_TOT_MEM=260609088

# Remote communication
# If you do not use MPICH, comment them, else modify the MPI_LOC for your machine

setenv USE_MPI  y
setenv USE_MPIF y
setenv MPI_LOC  /usr/local/chemsoft/mpich2
setenv MPI_LIB  $MPI_LOC/lib
setenv MPI_INCLUDE  $MPI_LOC/include
setenv LIBMPI       "-lfmpich -lmpich "

# Code tree

setenv NWCHEM_TOP   /home/src4cluster/nwchem-5.1.1

# Platform

setenv NWCHEM_TARGET LINUX64

# Python configuration
# If you do not use PYTHON, comment them.

#setenv PYTHONHOME      /usr
#setenv PYTHONVERSION   2.5

# Blas configuration
# This is related to your own machine. Here I have used MKL Blas. If you do not have any own Blas, comment all

setenv MKLLIB  /opt/intel/Compiler/11.1/069/mkl/lib/em64t
setenv MKLINC  /opt/intel/Compiler/11.1/069/mkl/include
setenv MKLLINK1 "-lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread"
setenv MKLLINK2 " -lmkl_core -lmkl_lapack95_lp64 -liomp5 -lpthread"

setenv BLASOPT  "-L${MKLLIB}    $MKLLINK1 $MKLLINK2 "

# What will be compiled

setenv NWCHEM_MODULES "all"

# Starting...
# Set your own complier

make FC=ifort CC=icc  

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:22 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
很好很好
并行得了
2楼2010-06-02 21:23:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可惜不是资源帖,上次编译一次
老是出错,最后放弃
参考一下,明天接着试试
谢谢分享
3楼2010-06-02 23:34:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuxuan1976

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
赞cool
4楼2010-06-03 10:54:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
建议版主给设一个QC强贴
5楼2010-06-08 17:04:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

有话请说

铁虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

我刚准备装的,谢谢楼主的分享!
6楼2010-07-03 15:19:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tengh

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主强大,我正在准备安装!
7楼2010-11-02 22:04:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sangym

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

太好了!!可以试试!!
8楼2010-11-03 10:25:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meixinqing

金虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

lz用的什么平台?我找不到setenv这个命令。。。


$ setenv
-bash: setenv: command not found
9楼2010-12-20 21:28:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
引用回帖:
Originally posted by meixinqing at 2010-12-20 21:28:18:
lz用的什么平台?我找不到setenv这个命令。。。


$ setenv
-bash: setenv: command not found

setenv是Csh的命令,你得装csh
10楼2010-12-20 22:08:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meixinqing

金虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by coolrainbow at 2010-12-20 22:08:05:



setenv是Csh的命令,你得装csh

谢谢
用export貌似得到了一样的效果,正在编译中。。。好像比较慢

下载编译好的貌似也能用,但不知道是不是影响并行计算,自己编译试试。谢谢lz分享
11楼2010-12-20 22:36:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jove1782

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

这样看来还是Bash简单

那啥 无聊中 尝试Intel MPI Lib编译中

忽然想换Scientific Linux 没办法垃圾ATI显卡 笔记本真郁闷

coolrainbow是隔壁学校的高人么?
我好想认真学量化啊。。。

其实开始是因为01年开始 我喜欢上了Linux 所以间接想学计算

当年是因为管道太可爱了。。。 So卡哇伊

[ Last edited by jove1782 on 2012-5-28 at 14:51 ]
12楼2012-05-28 14:49:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 coolrainbow 的主题更新
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕326求调剂 +4 墨煜姒莘 2026-03-15 4/200 2026-03-15 11:02 by dyw
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 211本,11408一志愿中科院277分,曾在中科院自动化所实习 +3 Losir 2026-03-12 3/150 2026-03-14 12:11 by 热情沙漠
[考研] 085600求调剂 +3 a邵星池 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:32 by JourneyLucky
[考研] 306求调剂 +4 唐薏薏 2026-03-09 4/200 2026-03-14 01:19 by JourneyLucky
[考研] b区环境工程求调剂 +4 Maps1 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:23 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕288分求调剂 一志愿211 +4 在家想你 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:49 by JourneyLucky
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
[考研] 收调剂 +7 调剂的考研学生 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:57 by 麦茶汤圆
[硕博家园] 木虫好像不热闹了,是不是? +4 偏振片 2026-03-10 4/200 2026-03-10 09:51 by longwave
信息提示
请填处理意见