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lylovess

禁虫 (初入文坛)

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ben1147

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+2):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-06-02 22:38:25
引用回帖:
Originally posted by lylovess at 2010-06-02 13:15:23:
已经有fasta格式,而且也都分别转换成meg格式。关键就是在建树的时候,都是提示的我选择的序列数目不够。是不是建树前必须进行clustal比对。。。。我很迷茫,谁有mega建树的具体步骤

要比对啊
fasta如果全是原始的序列数据,没有比对过的话,序列长度可能不一样,没法建树
要先比对过,有gap的地方用-补齐,各个序列长度一样才能分析
6楼2010-06-02 16:36:06
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zsxnd

铁杆木虫 (著名写手)


1949stone(金币+1):谢谢交流 2010-06-01 08:46:27
可能是你把你要比的多个数据以FASTA格式放在一起,然后再怎么激活添加,我现在忘了。
2楼2010-06-01 07:57:13
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ben1147

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1):感谢交流~~ 2010-06-02 18:48:27
最好不要单独添加

一次把所有要分析的序列都放在一个文件里(fasta也行,phy也行),然后转成meg格式再分析
3楼2010-06-01 10:03:24
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
先将数据写成FASTA格式,然后用CLUSTAL比对,比对结果用MEGA4 N-J法扩展值为1000就可生成进化树了。
4楼2010-06-01 10:35:42
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