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mafei028铜虫 (初入文坛)
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【求助】固体的红外吸收谱能不能算啊 已有3人参与
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如题。如果能算，要用什么算？ [ Last edited by wuli8 on 2010-5-31 at 20:41 ] ？ [ Last edited by mafei028 on 2011-8-21 at 10:58 ] |
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2楼2010-05-31 19:26:32
mafei028
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ChemiAndy
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gavinliu7390(金币+3):谢谢交流！ 2010-06-01 10:49:26
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很多第一性原理分子动力学软件可以计算。 因为红外吸收是电磁波与周期性振动的dipole moment产生的电磁场相互作用产生的，因此，只要获得你这个固体体系的dipole moment随时间变化的轨迹，然后做自相关函数的傅立叶变化，即可将时间-dipole信号，转变为频率-吸收强度信号。 要获得dipole moment随时间变化的轨迹，可以使用CPMD, cp2k等基于DFT密度泛函的分子动力学模拟软件，生成一个大约20ps-40ps的动力学轨迹，每个运动步计算体系的dipole moment即可得到dipole轨迹。注意1.这里的体系dipole moment并非每个分子的dipole moment，而是整个模拟体系的dipole moment，它的周期性变化包含了各个基团的振动对总dipole moment的贡献； 2.准确计算体系dipole是关键，要选取合适的电子相关处理方法（广域梯度近似GGA比局域密度近似LDA要好，因为dipole计算需要准确的电子密度的梯度信息）和合适的交换相关泛函(PBE, BLYP, BP)，并测试所用的赝势。 得到体系dipole的演化轨迹以后，即可计算其自相关函数的傅立叶变化，可将时域信号转换成频域信号，而频域信号的傅立叶变化在整个时间上的积分则可以得到在各频率上的吸收强度。具体理论可以参考文献：CPMD计算IR spectrum, M.P. Gaigeot, JCTC, 1, 772-789, 2005 推荐你使用CPMD，关于dipole轨迹的自相关-傅立叶变化的处理见： http://groups.google.ca/group/cp ... ad/a6a15953029189f9 |
4楼2010-06-01 05:02:29
mafei028
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5楼2010-06-01 11:45:25
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