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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】siesta中transiesta模块的收敛问题
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
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Originally posted by redskywei at 2010-06-22 14:24:58:


好像是的，俺们就是直接看他的计算文件，论文倒是没看。呵呵～～

你看一下是不是因为自洽计算中使用的DM.MixingWeight不一样啊！这个数小了对收敛有帮助，还有一个就是TS.MixH这个选项设置为T的时候对收敛有一定的加速作用（这个选项我没有使用过，这个选项用了之后，说明书上好像说上面的选项就被取代了）
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弘德明志博学笃行
11楼2010-07-22 10:32:49
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
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引用回帖:
Originally posted by redskywei at 2010-06-22 14:24:58:


好像是的，俺们就是直接看他的计算文件，论文倒是没看。呵呵～～

（不好意思，这个发送重复了！）
你看一下是不是因为自洽计算中使用的DM.MixingWeight不一样啊！这个数小了对收敛有帮助，还有一个就是TS.MixH这个选项设置为T的时候对收敛有一定的加速作用（这个选项我没有使用过，这个选项用了之后，说明书上好像说上面的选项就被取代了）

[ Last edited by zhangguangping on 2010-7-22 at 04:17 ]
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弘德明志博学笃行
12楼2010-07-22 10:37:47
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zhangguangping

木虫 (著名写手)

想和你讨论一下TS.UpdateDMCROnly的作用

★ ★ ★
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zzy870720z(金币+2):感谢交流 2010-07-23 19:57:51
引用回帖:
Originally posted by redskywei at 2010-05-29 11:19:12:
最近在做transieta的计算，发现收敛困难，看maillist里主要考虑增加屏蔽层和设置TS.UpdateDMCROnly，我在设置TS.UpdateDMCROnly时，一直不明白这个东西到底是作用在整个散射区还是仅仅与电极结构相重复的散射区中 ...


就像上面的这个图片中显示的一样，中间散射区的原子坐标按照从左到右的顺序依次可以这样界定。当然第一项和最后一项有的时候不用，看手册上说一般是用在左右电极不对称的情形，为了使TS.NumUsedAtomsLeft和TS.NumUsedAtomsRight部分的密度矩阵重复出块体的数据，也就是营造一个块体的环境。TS.NumUsedAtomsLeft和TS.NumUsedAtomsRight部分其实就是进行电极单独计算的时候的坐标或者是其中的一部分。这部分的数据是直接读取的电极计算产生的数据。而这个数据在半无限大的电极计算中产生的，所以就代表了无限大电极对中间散射区（C区）的影响。这个部分就是电极的一部分。而中间的C区才是真真正正的散射区，这个部分由自由分子和屏蔽层组成。耦合项应该是指的电极部分和屏蔽层间的相互作用，因为要求分子和电极部分是不应该有相互作用的。这个相互作用也是电极的表层和屏蔽层的表层相互作用。所以如果屏蔽层比较大的话，在自恰的过程中，屏蔽层靠近电极的层的密度矩阵几乎不会变化，也就是说耦合项不变，这个时候只有分子和屏蔽层靠近分子的层自洽就可以了。但是如果屏蔽层比较少的话，自洽的过程中屏蔽层靠近电极的部分密度矩阵会发生变化，这个时候屏蔽层与电极的耦合就会发生变化，这个时候就要求TS.UpdateDMCROnly设置为F，耦合项一起更新。但是这个时候即使是耦合项变化了，计算中也不会使电极部分的密度矩阵发生变化，因为这个部分要重复块体的数据，这个时候就有点强制C区在边界条件下进行自洽，如果屏蔽层足够多的话，这个不用强制，是一种自然过渡的结果，但是屏蔽层多了，计算量就受不了了。但是至于屏蔽层少的时候，计算出来的结果的意义是什么，得讨论一下！
我上面说的只是我的一些看法，并且很不成熟，只是起到一个抛砖引玉的作用，让高手参与进来讨论一下，最终达到自己受教的目的而已!
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弘德明志博学笃行
13楼2010-07-22 11:12:45
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redskywei

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-07-22 11:12:45:


就像上面的这个图片中显示的一样，中间散射区的原子坐标按照从左到右的顺序依次可以这样界定。当然第一项和最后一项有的时候不用，看手册 ...

多谢,受教了.
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坠入无边的网~~
14楼2010-07-23 15:33:18
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