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铁虫 (著名写手)

方法
菌株和质粒
黑曲霉AB4.1 (van Hartingsveldt et al.,1987)是来源于黑曲霉N402的pyrG突变株。黑曲霉D15是菌株AB1.13的蛋白酶缺陷菌株(Mattern et al., 1992),D15能有效降低培养基的酸化(P. Punt, unpublished observation)。ile19突变株由David Gems((John Innes Centre,Norwich, UK))友情提供。编码GFP突变体S65T (Chiu et al., 1996; Haas et al., 1996)的sgfp基因被用在所有的构建中。质粒pMCB30(Fernandez-Abalos et al., 1998)和pBluescript-sGFP-TyG-nos-hs(Sheen
et al., 1995)均含有sgfp基因。质粒pIGF含有黑曲霉glaA启动子和截短的glaA基因(相当于499个氨基酸,G499)和glaA终止区域(Archer et al., 1994)。质粒pAN56-2含有glaA启动子和截短的glaA基因(相当于514个氨基酸,G514)和黑曲霉trpC终止区域(EMBLZ-32690)。含有黑曲霉pyrG基因(van Hartingsveldt et al., 1987)的质粒pAB4.1和含有细菌潮霉素抗性(Punt et al., 1987; Punt & van den Hondel, 1992)的质粒pAN7.1被用作筛选转化菌株。

生长和培养条件
含sGFP、GLA514融合蛋白质的黑曲霉在BenneH}Lasure培养基上培养,而含GLA499融合蛋白的菌株在Vogel的培养基上生长(Vogel, 1956)(经修改用10g蔗糖取代麦芽糖糊精或葡萄糖),如果需要用1.5%琼脂固化。为了镜检,含有融合蛋白质的菌株的孢子粘合在盖玻片上,在Petri碟中并在一层薄的培养基上生长(Harris et al., 1994)。一种经过修改的soya milk 培养基也被应用(MacKenzie et al., 1994)。pyrG突变株的培养基中含有10mM尿苷。无性孢子的孵育在PDA培养基上进行,培养5-6天后用0.1%吐温20收获并用水冲洗2次。所有的培养物在30度培养,如有需要可250转/分搅拌培养。

构建基因融合和转化子
质粒抽提、酶切、DNA连接和大肠杆菌转化参见Sambrook描述(Sambrook et al. (1989))。图一显示不同的构建。为了构建GLA499: : sGFP编码区,以pMCB30为模板PCR扩增全长的742bp sgfp基因。引物为(1) 5«-CGATATCTAGAATGGTGGCAAGGGCGAGGA, (2) 5«-TGACTTCTAGATTACTTGTACAGCTCGTCCA。sgfp片段经酶切并连入pIGF上位于glaA基因和glaA终止区域中的XbaI克隆位点。GLA514: : sGFP编码基因是通过从pBluescript-sGFP-TyG-nos-hs(Sheen et al., 1995)克隆sgfp并在两端加上NcoI(平端)和BamHI位点,而形成载体pAN56-2sGFP。为了构建GLA514: : sGFP-HDEL融合基因,以pBluescript-sGFP-TyG-nos-hs(Sheen et al., 1995)为模板。引物为(1)在pBluescript反式引物5«-GGAAACAGCTATGACCATG, and (2) sGFP-HDEL反式引物 5«-CGGGATCCTTACAG CTCGTCGTGCTTGTACAGCTCGTCCATGCC.882bp的sGFP-HDEL片段通过NcoI和BamHI酶切并克隆到pAN56-2而产生pAN56-2 (sGFP-HDEL)。所有的构建都通过测序验证。细胞质蛋白sGFP按照Siedenberg的描述构建(Siedenberg et al. (1999))。

对于转化实验,黑曲霉在Vogel培养基(对于AB4.1菌株额外补充10mM的尿苷)上培养18-20小时。原生质体通过加20mg的Novozyme 234 (Novo Nordisk) (g wet wt mycelia)-1制的,利用聚乙二醇(Punt&van den Hondel, 1992)把含有sgfp质粒pAB4.1和pAN7.1分别转化到AB4.1和N402菌株。转化子经过纯化,sgfp的存在通过Southern杂交(Southern, 1975)和菌落PCR验证(van Zeijl et al., 1998)。
11楼2010-05-31 18:17:27
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铁虫 (著名写手)

镜检
载有含有细胞质蛋白sGFP和gls514融合蛋白质的菌株的荧光检测由Zeiss axioplan显微镜控制。并应用标准FITC过滤器。在室温下过夜,并通过溶解在0.5M二甲胂酸钠的2.5%(V/V)戊二醛和0.05%(V/V)Nonidet P40来固定菌丝体。脱水通过事先经过-35度预冷的乙醇进行。在低温下,真菌组织被嵌入到含有0.05%(w/v)安息香甲醚的LR白树脂中,并在-20度下通过UV检测菌体的聚合。含有金粒的部分通过1%(w/v)乙酰基化的BSA(Aurion BSA-C)和0.01%(V/V)Tween 20封堵一小时。金粒与抗sGFP抗体(Clontech polyclonal anti-
sGFP)以1:15在4度共培养过夜。用PBS洗三遍后,与连有金粒的山羊抗兔抗体(Biocell)在室温下共培养1小时。一级和二级抗体利用黑曲霉的丙酮粉相互吸附。用PBS洗过后,部分区域用1%的戊二醛固定15分钟,并在染色前用水洗四次。后用乙酸双氧铀/柠檬酸铅染色并用JEOL 1200EX显微镜观察。
12楼2010-05-31 18:50:56
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铁虫 (著名写手)

lanlan_zhu(金币+430): 2010-05-31 19:38:44
分析方法
通过测量干重来判定生长情况,菌丝体过滤膜(Whatman no. 1)后干燥到恒重。菌体培养基过0.2um并储存在-20度。为了测液体培养基中的相对荧光强度,1.5ml的样品用带有508nm 散射过滤器的Hitachi 2000在490nm处激发。红移的重组GFP被用作对照。用标准的流程做SDS-PAGE(Sambrook et al., 1989)。按照Towbin描述(Towbin et al. (1979))电转化蛋白至纤维素膜上。用1:500稀释的山羊抗兔抗体(Clontech)来免疫检测sGFP。用1:5000稀释的兔抗转化酶抗体(由Novo Nordisk慷慨提供)来免疫检测转化酶。为了研究sGFP被降解情况,7ug重组sGFP蛋白质与来源于对数期末期的140ul菌体培养物共培养达6小时。样品被间隔控制并做Western杂交验证。

突变并筛选分泌途径中突变体
N402菌株的孢子悬浮液(20ml,含有GLA499: : sGFP融合蛋白)进行紫外突变(UVP; model R-52G),照射40s杀死95-99%孢子。突变孢子被涂布在修改的的Vogel培养基上(含有0.1%(w/v)葡萄糖和0.05%(v/v)Triton X-100),孢子的密度控制在25度下培养3天后,长出30-50个菌落。加入Triton X-100以控制菌落的生长。融化的Vogel淀粉培养基(含有1%(w/v)玉米淀粉,10ml)被小心的倒在含菌落的平板上并42度培养24小时。以前的研究表明在培养6到14小时时没有突变的菌落会产生可见的光环。培养24小时后仍不见光环的菌落挑到另一个含淀粉的平板上并在25和42度培养再筛选。来自第二次筛选的突变体的孢子悬浮液或者菌丝体棉塞(直径4mm)培养在Vogel’s gelatin培养基中(含有1%葡萄糖,1%(w/v)明胶,0.05%Triton X-100和不含硫酸铵)在25和42度分别培养4和2天。以前的研究已经表明不突变的菌落在25和42度分别培养18-24小时和6-14小时时会在菌落四周产生透明的区域。
13楼2010-05-31 19:36:24
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