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【求助】质谱搜库失败是为什么? 已有1人参与
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各位大侠,帮帮忙: 我把马的肌红蛋白用标准的溶液酶解法进行酶解,(铵盐-DTT-IAA),然后将混合物喷入Thermo的LCQ离子井电喷雾质谱里,质谱经过校正,得到的谱图和蛋白谱图相比,能看到蛋白被酶解的明显差别,但是进入MASCOT检索却检测不到。条件如下所示: 谱库:Swiss Prot; 固定修饰:Carbamidomethyl (M);选择性修饰:Oxidation(M); 误差 +-3 ;charge:1+ 2+ 3+; 分别用peptide fingerprint 和MS/MS 检索过,但是都有问题。 另外,peptide fingerprint 和MS/MS的功能分别是指向什么应用的。 因为我刚刚接触,实验室又没有基础,所以只能靠各位达人提点了,谢谢!!! |
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