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【求助】质谱搜库失败是为什么？ 已有1人参与
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各位大侠，帮帮忙： 我把马的肌红蛋白用标准的溶液酶解法进行酶解，（铵盐-DTT-IAA），然后将混合物喷入Thermo的LCQ离子井电喷雾质谱里，质谱经过校正，得到的谱图和蛋白谱图相比，能看到蛋白被酶解的明显差别，但是进入MASCOT检索却检测不到。条件如下所示： 谱库：Swiss Prot； 固定修饰：Carbamidomethyl （M）；选择性修饰：Oxidation（M）； 误差 +-3 ；charge：1+ 2+ 3+； 分别用peptide fingerprint 和MS/MS 检索过，但是都有问题。 另外，peptide fingerprint 和MS/MS的功能分别是指向什么应用的。 因为我刚刚接触，实验室又没有基础，所以只能靠各位达人提点了，谢谢！！！ |
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