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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】吸附求助！
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liang7035

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】吸附求助！ 已有2人参与

请问各位高手，我优化的晶胞往里面加O做吸附，为什么加到fcc三重洞位的时候，晶胞的最底层原子就没了，这是怎么回事啊，反而没有经过优化的晶胞加O的时候，一切都正常啊！大家给我看看问题出现在那！谢谢！
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一个一心向上的人整个世界都会给他让路！
1楼 2010-05-12 21:04:22
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liang7035

金虫 (正式写手)
高手都哪去了啊！怎么没人回答啊！
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一个一心向上的人整个世界都会给他让路！
2楼2010-05-13 18:22:46
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hgye

金虫 (小有名气)
★ ★
liang7035(金币+2):谢谢参与
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-05-13 19:12:36
liang7035(金币+2): 2010-05-13 19:52:39
没加O的模型中，所看到的最上边和最底下的是同一层原子，c方向坐标为零；加了O以后，最底层原子弛豫后c方向坐标成为负的，从模型顶端进入。
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3楼2010-05-13 19:03:07
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liang7035

金虫 (正式写手)
谢谢高手指点啊！呵呵。。多谢！
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一个一心向上的人整个世界都会给他让路！
4楼2010-05-13 19:48:10
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liang7035

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hgye at 2010-05-13 19:03:07:
没加O的模型中，所看到的最上边和最底下的是同一层原子，c方向坐标为零；加了O以后，最底层原子弛豫后c方向坐标成为负的，从模型顶端进入。

再问一下高手，我的这种情况，是否能继续往下做？正常不啊？
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一个一心向上的人整个世界都会给他让路！
5楼2010-05-13 20:44:56
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hgye

金虫 (小有名气)
★
zzy870720z(金币+1):xiexie 2010-05-13 22:31:45
liang7035(金币+2): 2010-05-14 08:26:09
引用回帖:
Originally posted by liang7035 at 2010-05-13 20:44:56:

再问一下高手，我的这种情况，是否能继续往下做？正常不啊？

正常的，周期性结构，不影响计算，只是看图不方便。
不过需要考虑，为什么只用了三层原子，够吗？另外做表面一般需要把底下几层原子固定不让弛豫，你应该没有固定，不知道你要做的具体问题是什么。
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6楼2010-05-13 22:29:44
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liang7035

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hgye at 2010-05-13 22:29:44:

正常的，周期性结构，不影响计算，只是看图不方便。
不过需要考虑，为什么只用了三层原子，够吗？另外做表面一般需要把底下几层原子固定不让弛豫，你应该没有固定，不知道你要做的具体问题是什么。

谢谢你的回复啊，呵呵，，三层是不够，我为了方便就那这个三层的为例，几层原子固定不让弛豫 就把下面要固定的原子全部选了，然后Modify Constraints 中勾选上Fix fractional position，这样就固定了吧？不知道这样做对吗？
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一个一心向上的人整个世界都会给他让路！
7楼2010-05-14 08:32:28
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