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lovemydog

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】缔合物建模 已有2人参与

最近在研究缔合物性质。现在有个问题想请教一下大家,在用ms建模时,缔合物分子间的连接的键应该选择什么形式?是共价键还是离子键,有没有自定义形式的,就比如自己设置键长和键角的?
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lovemydog

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-05-08 10:29:09:
貌似你这个体系用量化比较合适,不适合用分子动力学模拟,li,金属离子,这些东西的力场都不好找

离子键该怎么处理,也用共价键表示?
5楼2010-05-09 11:30:20
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):感谢交流! 2010-05-07 22:53:26
个人观点,不用设置
2楼2010-05-07 20:18:13
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lovemydog

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-05-07 20:18:13:
个人观点,不用设置

那应该怎么设置呢?比如正丁基锂是6元缔合,一个锂要连上2个正丁基,那如果这个锂原子与这两个丁基均用共价键连接的话,是不是不太符合化学合理性,因为一个锂好像只能成一个共价键?另外ms建模时,离子键该怎么处理,也用共价键表示?
3楼2010-05-08 08:50:31
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wuli8(金币+1):3q 2010-05-08 18:39:58
貌似你这个体系用量化比较合适,不适合用分子动力学模拟,li,金属离子,这些东西的力场都不好找
4楼2010-05-08 10:29:09
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