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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】运行vasp时出现问题
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zhang668

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】运行vasp时出现问题 已有2人参与

从服务器上别人的vasp程序拷贝过来运行时，遇到找不到mkl的库问题。
./vasp: error while loading shared libraries: libmkl_intel_lp64.so: cannot open shared object file: No such file or directory

这个是从别人那里拷贝过来的vasp直接放在目录下，在都一个服务器上。
我修改了.bashrc里的LD_LIBRARY_PATH，把lib下的em64t,64,32三个目录都加了进去，还是不行。
不知道还要修改哪些？这个是.bashrc文件
# .bashrc
alias vim='vi'

# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc
fi

# User specific aliases and functions

#export PATH=/opt/openmpi/bin:$PATH:/gpfssan1/apps/intel/mkl/10.2.1.017/lib
#export LD_LIBRARY_PATH=/opt/openmpi/lib:$LD_LIBRARY_PATH:/gpfssan1/apps/intel/mkl/10.2.1.017/lib/em64t:/gpfssan1/apps/intel/mkl/10.2.1.017/lib/64:/gpfssan1/apps/intel/mkl/10.2.1.017/lib/32:/gpfssan1/apps/intel/fce/10.1.022/lib
source /gpfssan1/apps/intel/fce/10.1.022/bin/ifortvars.sh
source /gpfssan1/apps/intel/Compiler/11.1/064/bin/intel64/iccvars_intel64.sh
source /gpfssan1/apps/intel/Compiler/11.1/064/bin/intel64/ifortvars_intel64.sh
source /gpfssan1/apps/intel/Compiler/11.1/064/bin/intel64/idbvars.sh
source /gpfssan1/apps/intel/Compiler/11.1/064/mkl/tools/environment/mklvars64.sh
source /gpfssan1/apps/intel/impi/3.2.1.009/bin64/mpivars.sh
export NETCDF=/gpfssan1/apps/netcdf-4.0.1-intel
#export NETCDF=/gpfssan1/apps/netcdf-4.0.1-tmp/netcdf-4.0.
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1楼 2010-04-21 11:38:02
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
★ ★
zhang668(金币+1):谢谢参与
hometownlove(金币+1):谢谢交流 2010-04-21 14:09
最好是自己编译下，直接拷贝的环境不一样，mkl版本也可能不同，运算可能会有问题
ldd vasp
看看有什么库找不到，把那些库拷贝到/lib文件夹里
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2010-04-21 12:30:37
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zhang668

木虫 (正式写手)
这个vasp都是在学校高性能计算服务器上安装的，mkl环境应该是一样的。
编译前后mkl会有变化吗
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3楼2010-04-21 13:04:57
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zhang668

木虫 (正式写手)
这三个库找不到。libmkl_intel_lp64.so => not found
        libmkl_sequential.so => not found
        libmkl_core.so => not found

是必需要重新编译吗？
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4楼2010-04-21 13:06:04
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
zhang668(金币+4): 2010-04-21 16:52
不想编译的话就把mkl的这几个文件拷贝到/lib里面看看行不行
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
5楼2010-04-21 16:30:46
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zhang668

木虫 (正式写手)
已经解决了，把mkl的lib路径添加到LIBRARY_PATH就可以了，我原来犯了个错误，没把注释号去掉，所以出现这个错误。
还是多谢LS。
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6楼2010-04-21 16:54:27
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