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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】PBS脚本 loop.sh脚本并行计算的问题
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟

[交流] 【求助】PBS脚本 loop.sh脚本并行计算的问题 已有2人参与

大家好，我用sample.pbs脚本提交任务，官方Hands on Si的例子 里面有个loop.sh的脚本，虽然单机执行就够了，但我现在想让它并行执行，即每个i都是并行执行，请问改怎么办，sample.pbs是用来提交单个并行任务的，麻烦大家指点下，非常感谢！
loop.sh 脚本
#! /bin/bash
BIN=/home/local/vasp.4.6/vasp
rm WAVECAR
for i in  3.5 3.6 3.7 3.8 3.9 4.0 4.1 4.2 4.3 ; do
cat >POSCAR < fcc:
   $i
0.5 0.5 0.0
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
   1
cartesian
0 0 0
!
echo "a= $i" ; $BIN
E=`tail -1 OSZICAR` ; echo $i $E  >>SUMMARY.fcc
done
cat SUMMARY.fcc
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1楼 2010-04-20 10:39:20
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
★ ★ ★
xiaohunhun(金币+3):xiexie 2010-04-20 11:54
calos818(金币+1): 2010-04-20 12:30
应该是把最后执行命令的语句改了就行，就该第四行就行
echo "a= $i" ; mpirun -np 核数 $BIN
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2010-04-20 11:43:50
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-04-20 11:43:50:
应该是把最后执行命令的语句改了就行，就该第四行就行
echo "a= $i" ; mpirun -np 核数 $BIN

谢谢
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3楼2010-04-20 12:30:35
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