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cqyc007

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】有谁了解GC-MS中的NIST谱库的MSMS匹配原理 已有8人参与

GC-MS在定性的时候,未知化合物的EI-MS谱图会和NIST08或其他版本的标准谱图通过某种算法来进行匹配,最后得到一个相似度,用以判断未知化合物。

在这里我请教各位高手:
1. 未知化合物和标准谱图进行相似度计算的时候,相似度是通过什么方法计算出来的?算法是什么?

2. 质量数和相对丰度在计算相似度时有权重区别吗?

3. 计算相似度时要考虑哪些离子(响应在1%以上的离子还是其他什么标准?)

有了解这个的朋友吗?或者提供相关的资料,必重谢!

[ Last edited by cqyc007 on 2010-4-16 at 16:32 ]
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nkcontrast

捐助贵宾 (小有名气)

cqyc007(金币+10):非常感谢,我再仔细看看 2010-04-22 19:43
NIST 08使用An Automated MS Deconvolution and Identification System来做判别,简称为AMDIS。详细信息,可见下面的网站

http://chemdata.nist.gov/mass-spc/amdis/

具体的操作分为几步,好像没有具体有说明。

The overall process involves four sequential steps.

noise analysis
component perception
spectral "deconvolution"
compound identification

此后,

http://chemdata.nist.gov/mass-spc/amdis/overview/page6.htm
       
Once the components are indicated and the spectra are purified, AMDIS runs a search algorithm to match (Identify) each spectrum to a library spectrum.

Unlike a traditional identification algorithms, AMDIS includes uncertainties in the deconvolution, purity, and retention times in the match factor.   The final match factor is a measure of both the quality of the match and of the confidence in the identification.

但并没给给出具体的算法。

这是我查到的最直接的信息。希望对你有帮助。
引用回帖:
Originally posted by cqyc007 at 2010-04-16 15:26:22:
GC-MS在定性的时候,未知化合物的EI-MS谱图会和NIST08或其他版本的标准谱图通过某种算法来进行匹配,最后得到一个相似度,用以判断未知化合物。

在这里我请教各位高手:
1. 未知化合物和标准谱图进行相似度计 ...

11楼2010-04-22 16:40:02
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platinhom

木虫 (正式写手)

cqyc007(金币+1):谢谢,可能是我没说清楚 2010-04-16 16:31
不太清楚。。。but MS/MS和标准图库无法匹配的吧,标准图库用70eV,MS/MS用的能量参数是不同的。。。
懒猪一只
2楼2010-04-16 16:16:22
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babyfast

金虫 (正式写手)

cqyc007(金币+5):那高丰度的离子是怎么比较的呢?兄台知道具体的比对方法吗? 2010-04-17 21:09
好像是看有多少个峰是匹配的,主要从高丰度的开始比对吧。这个你不能完全相信比对结果,因为有的杂质或是柱流失和残留可能产生某特征离子碎片,干扰整个谱图解析,或是有共流出主份,不要看匹配度高就认为一定是匹配上的切忌切忌。
4楼2010-04-17 18:38:59
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330685car

木虫 (正式写手)

cqyc007(金币+2):兄台知道具体的方法吗?望指教 2010-04-17 21:10
好像是与出峰位置和相关峰的高度比有关,联各个元素的化学丰度求解。
5楼2010-04-17 18:44:26
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