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lvyanni

金虫 (初入文坛)

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专业: 生物大分子结构与功能

[交流] 【求助】【GOLD中如何算RMSD?】

各位大虾好：
   请问GOLD中如何算RMSD，就是“对接构象对晶体中配体构象的重现程度”
   计算完毕后，文件中有：
RMSD Matrix of RANKED solutions

      2 3 4 5 6 7 8 9 10

1 :  0.3  0.2  5.3  0.8  5.3  5.2  5.2  1.4  5.4
2 :    0.3  5.3  0.8  5.3  5.2  5.2  1.4  5.4
3 :          5.3  0.7  5.3  5.2  5.2  1.4  5.4
4 :                5.4  1.0  0.4  0.3  5.3  2.2
5 :                   5.4  5.3  5.3  1.6  5.4
6 :                         1.3  1.1  5.3  1.9
7 :                               0.3  5.3  2.4
8 :                                  5.2  2.3
9 :                                        5.2

这个solution没加的，但是怎么会出现这个solution，它的RMSD和上述文字中的RMSD不是一个概念吧？
希望各位帮帮忙了！

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1楼 2010-04-12 22:25:24

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