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yaoed

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】怎么自定义溶剂 已有5人参与

在进行scrf=PCM计算溶剂化能时。可选溶剂中没有正己烷,我想自定义这个溶剂。参照高斯手册,需要eps和rsolv两个基本参数。但不知道rsolv(溶剂半径)是怎么得来的,那位大侠帮助一下。
是直接查实验数据?还是计算得来的?
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放飞梦想
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hzfish

金虫 (正式写手)

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aylayl08(金币+2):感谢讨论 2010-04-13 21:04
自定义溶剂最好要指定以下四个参数:

EPS=?
RSOLV=?
DENSITY=?
VMOL=?
3楼2010-04-13 19:47:11
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easygeton

铜虫 (小有名气)

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zhou2009(金币+2): 2010-04-13 19:19
严格的说要自己根据一系列实验值进行参数化,但是一般人不会这么做:)
简单的方法有两个:
一是查溶剂的密度,然后求出摩尔体积,再除以阿伏伽德罗常数(高中化学知识)。
二是用高斯的volume关键字,可以算出个半径,但是高斯手册里说这个半径是为Osager溶剂化模型准备的,所以只是近似的可以用在PCM溶剂化计算中。
2楼2010-04-13 18:23:50
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czyzsu

专家顾问 (文坛精英)


★ ★
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zhou2009(金币+1): 2010-04-16 18:45
5楼2010-04-16 18:41:10
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★ ★
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aylayl08(金币+2):谢谢指教 2010-04-20 17:45
分子半径不是一个好定义的量, 现在的第一原理计算也不可能准确计算分子间作用
庆幸的是半径精度差一点对结果影响不大, 比如水用1.2和1.35得到的结果没有区别
volume 计算得到半径可以用于pcm 计算,
6楼2010-04-16 20:05:48
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