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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】分子力学计算程序Macromodel
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一步一步

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】分子力学计算程序Macromodel 已有3人参与

大家谁有破解版本的分子力学计算程序Macromodel 啊？？

用同源建模方法得到了蛋白质，然后与小分子配体对接了。

想用Macromodel对得到的蛋白质复合物进行MD simulation.

或者谁知道除了这个程序之外，还有哪些程序可以对蛋白质-小分子复合物进行MD simulation??

麻烦帮忙提供一下，谢谢了！

我的邮箱：changshayuling@yahoo.cn

谢谢好心人的帮助！
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1楼 2010-04-09 18:33:59
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-13 11:08
引用回帖:
Originally posted by 一步一步 at 2010-04-09 18:33:59:
大家谁有破解版本的分子力学计算程序Macromodel 啊？？

用同源建模方法得到了蛋白质，然后与小分子配体对接了。

想用Macromodel对得到的蛋白质复合物进行MD simulation.

或者谁知道除了这个程序之外，还 ...

你现在不是开始用NAMD了嘛？呵呵~NAMD就可以啊~除此之外，AMBER也可以啊，不过如果你们没有版权，还是用NAMD吧~呵呵
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2楼2010-04-13 11:00:49
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一步一步

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-04-13 11:00:49:

你现在不是开始用NAMD了嘛？呵呵~NAMD就可以啊~除此之外，AMBER也可以啊，不过如果你们没有版权，还是用NAMD吧~呵呵

嘿嘿。。。这个是之前发的。
在分子模拟论坛上有人推荐我用NAMD或desmond.
所以现在正在学习NAMD呢。
谢谢关心与帮助，
还有老大心肠真好
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3楼2010-04-13 16:49:23
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bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-13 20:40
到网上搜，在Schrodinger包里，网上有2006, 2007, 2008 & 2009版。
一切看你运气。
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4楼2010-04-13 20:23:07
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