【求助】关于geom=connectivity的作用和用法 - 计算模拟 - 第2页小木虫论坛-学术科研互动平台

11楼2011-03-19 16:17:22

天下枫叶

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6楼: Originally posted by userhung at 2010-04-11 08:34:00:
Geom=Connectivity只影响使用分子力学计算哦~~~

你好，在频率计算和结构优化时，geom=write connectivity必须要用上吗

12楼2011-08-02 22:00:43

necturnal

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我也在困惑这个问题。突然想到最近遇到的一个难题：
有些时候，当两个原子间距离超过高斯设定的成键值的时候，就不显示成键。但是实际上，这个两个原子之间还是有作用的。但是高斯在读内坐标的时候，不会把这个作用读进去，我记得老板好像是让我把这个键长的数值直接加到input的分子结构说明部分。
这个geom=connectivity是不是相似的，比如想让某两个并不显示成键的原子之间成键，于是画图时加上键的显示，然后用geom=connectivity然后进行结构优化……
本人菜鸟一个希望有高人能来解答这个问题。

13楼2011-12-07 18:11:08

qwerasdf2783

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dbb627(金币+1): 欢迎交流 2011-12-08 18:28:16

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13楼: Originally posted by necturnal at 2011-12-07 18:11:08:
我也在困惑这个问题。突然想到最近遇到的一个难题：
有些时候，当两个原子间距离超过高斯设定的成键值的时候，就不显示成键。但是实际上，这个两个原子之间还是有作用的。但是高斯在读内坐标的时候，不会把这个作 ...

算的时候只与原子的位置有关，至于怎么输入的，到了程序里面刚开始算的时候就处理了，输入时以设定的键根本没用。
优化出来的只有原子的位置，如果是在GV里看，长到一定程度就不显示了。可以手动设定显示键，但什么都不影响。

14楼2011-12-08 10:27:41

necturnal

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14楼: Originally posted by qwerasdf2783 at 2011-12-08 10:27:41:
算的时候只与原子的位置有关，至于怎么输入的，到了程序里面刚开始算的时候就处理了，输入时以设定的键根本没用。
优化出来的只有原子的位置，如果是在GV里看，长到一定程度就不显示了。可以手动设定显示键，但 ...

谢谢帮助。
我试了一下，确实加入设定的键，优化过程和没有加入键长结果是一样的。

15楼2011-12-09 04:48:14

fangq

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In a frozen-atom calculation, if wothout geom=connectivity,
such as
# opt=ModRedundant b3lyp/6-311g(d) pop=reg
The calculation will fail.

However, if geom=connectivity added, such as
# opt=ModRedundant b3lyp/6-311g(d) geom=connectivity pop=reg
The calculation will go.

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16楼2012-02-19 15:16:23