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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 【求助】关于geom=connectivity的作用和用法
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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fxiyue

铁杆木虫 (著名写手)
★
qwerasdf2783(金币+1):谢谢参与
不太清楚，呵呵
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11楼2011-03-19 16:17:22
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天下枫叶

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by userhung at 2010-04-11 08:34:00:
Geom=Connectivity只影响使用分子力学计算哦~~~

你好，在频率计算和结构优化时，geom=write connectivity必须要用上吗
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12楼2011-08-02 22:00:43
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necturnal

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
我也在困惑这个问题。突然想到最近遇到的一个难题：
有些时候，当两个原子间距离超过高斯设定的成键值的时候，就不显示成键。但是实际上，这个两个原子之间还是有作用的。但是高斯在读内坐标的时候，不会把这个作用读进去，我记得老板好像是让我把这个键长的数值直接加到input的分子结构说明部分。
这个geom=connectivity是不是相似的，比如想让某两个并不显示成键的原子之间成键，于是画图时加上键的显示，然后用geom=connectivity然后进行结构优化……
本人菜鸟一个希望有高人能来解答这个问题。
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13楼2011-12-07 18:11:08
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qwerasdf2783

金虫 (著名写手)
★
dbb627(金币+1): 欢迎交流 2011-12-08 18:28:16
引用回帖:
13楼: Originally posted by necturnal at 2011-12-07 18:11:08:
我也在困惑这个问题。突然想到最近遇到的一个难题：
有些时候，当两个原子间距离超过高斯设定的成键值的时候，就不显示成键。但是实际上，这个两个原子之间还是有作用的。但是高斯在读内坐标的时候，不会把这个作 ...

算的时候只与原子的位置有关，至于怎么输入的，到了程序里面刚开始算的时候就处理了，输入时以设定的键根本没用。
优化出来的只有原子的位置，如果是在GV里看，长到一定程度就不显示了。可以手动设定显示键，但什么都不影响。
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14楼2011-12-08 10:27:41
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necturnal

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
14楼: Originally posted by qwerasdf2783 at 2011-12-08 10:27:41:
算的时候只与原子的位置有关，至于怎么输入的，到了程序里面刚开始算的时候就处理了，输入时以设定的键根本没用。
优化出来的只有原子的位置，如果是在GV里看，长到一定程度就不显示了。可以手动设定显示键，但 ...

谢谢帮助。
我试了一下，确实加入设定的键，优化过程和没有加入键长结果是一样的。
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15楼2011-12-09 04:48:14
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fangq

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
In a frozen-atom calculation, if wothout geom=connectivity,
such as
# opt=ModRedundant b3lyp/6-311g(d) pop=reg
The calculation will fail.

However, if  geom=connectivity added, such as
# opt=ModRedundant b3lyp/6-311g(d) geom=connectivity pop=reg
The calculation will go.
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16楼2012-02-19 15:16:23
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804500719

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
顶起，不知道有什么用
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17楼2014-04-14 16:58:20
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木儒

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问，你现在搞清楚没，我还没搞清楚是怎么回事
赞一下 回复此楼
路不行不到，事不为不成！
18楼2016-03-24 10:55:21
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