应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 【求助】关于geom=connectivity的作用和用法
182/2返回列表上一页12
查看: 5219  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

fxiyue

铁杆木虫 (著名写手)
★
qwerasdf2783(金币+1):谢谢参与
不太清楚，呵呵
回复此楼
11楼2011-03-19 16:17:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天下枫叶

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by userhung at 2010-04-11 08:34:00:
Geom=Connectivity只影响使用分子力学计算哦~~~

你好，在频率计算和结构优化时，geom=write connectivity必须要用上吗
赞一下(1人) 回复此楼
12楼2011-08-02 22:00:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

necturnal

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
我也在困惑这个问题。突然想到最近遇到的一个难题：
有些时候，当两个原子间距离超过高斯设定的成键值的时候，就不显示成键。但是实际上，这个两个原子之间还是有作用的。但是高斯在读内坐标的时候，不会把这个作用读进去，我记得老板好像是让我把这个键长的数值直接加到input的分子结构说明部分。
这个geom=connectivity是不是相似的，比如想让某两个并不显示成键的原子之间成键，于是画图时加上键的显示，然后用geom=connectivity然后进行结构优化……
本人菜鸟一个希望有高人能来解答这个问题。
赞一下(1人) 回复此楼
13楼2011-12-07 18:11:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qwerasdf2783

金虫 (著名写手)
★
dbb627(金币+1): 欢迎交流 2011-12-08 18:28:16
引用回帖:
13楼: Originally posted by necturnal at 2011-12-07 18:11:08:
我也在困惑这个问题。突然想到最近遇到的一个难题：
有些时候，当两个原子间距离超过高斯设定的成键值的时候，就不显示成键。但是实际上，这个两个原子之间还是有作用的。但是高斯在读内坐标的时候，不会把这个作 ...

算的时候只与原子的位置有关，至于怎么输入的，到了程序里面刚开始算的时候就处理了，输入时以设定的键根本没用。
优化出来的只有原子的位置，如果是在GV里看，长到一定程度就不显示了。可以手动设定显示键，但什么都不影响。
赞一下(1人) 回复此楼
14楼2011-12-08 10:27:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

necturnal

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
14楼: Originally posted by qwerasdf2783 at 2011-12-08 10:27:41:
算的时候只与原子的位置有关，至于怎么输入的，到了程序里面刚开始算的时候就处理了，输入时以设定的键根本没用。
优化出来的只有原子的位置，如果是在GV里看，长到一定程度就不显示了。可以手动设定显示键，但 ...

谢谢帮助。
我试了一下，确实加入设定的键，优化过程和没有加入键长结果是一样的。
赞一下(1人) 回复此楼
15楼2011-12-09 04:48:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fangq

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
In a frozen-atom calculation, if wothout geom=connectivity,
such as
# opt=ModRedundant b3lyp/6-311g(d) pop=reg
The calculation will fail.

However, if  geom=connectivity added, such as
# opt=ModRedundant b3lyp/6-311g(d) geom=connectivity pop=reg
The calculation will go.
赞一下 回复此楼
16楼2012-02-19 15:16:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

804500719

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
顶起，不知道有什么用
赞一下 回复此楼
17楼2014-04-14 16:58:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木儒

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问，你现在搞清楚没，我还没搞清楚是怎么回事
赞一下 回复此楼
路不行不到，事不为不成！
18楼2016-03-24 10:55:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qwerasdf2783 的主题更新
182/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂 +8 调剂的考研学生 2026-03-09 8/400 2026-03-15 22:14 by Winj1e
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[教师之家] 焦虑 +5 水冰月月野兔 2026-03-13 7/350 2026-03-14 15:14 by 农药害害
[考研] 求调剂 +3 清风问长安 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:15 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +8 zchqwer 2026-03-10 8/400 2026-03-14 00:01 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 285 求调剂 资源与环境 一志愿北京化工大学 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:04 by JourneyLucky
[考研] 279求调剂 +3 Dizzy123@ 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:02 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 泣血叩求调剂恩，愿以丹心报师恩 +6 Iuruoh 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:06 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大，材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 332求调剂 +3 Zz版 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:36 by 18595523086
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 268求调剂 +4 好运连绵不绝 2026-03-12 4/200 2026-03-13 10:45 by hyswxzs
[考研] 求调剂 资源与环境 285 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:31 by houyaoxu
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭