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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】奇怪的结构优化，老是在第2步迭代开始时停止计算
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【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 calos818 的 2 个金币

calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟

[交流] 【求助】奇怪的结构优化，老是在第2步迭代开始时停止计算 已有4人参与

用VASP做结构优化，Iteration1 正常，但老是在Iteration 2 开始时返回forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred的信息，计算中止，集群重启了还是这样，请问是怎么回事，是设置原因还是集群硬件本身问题，请大家指导下，下面是迭代过程，
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
DAV:   1     0.591709595173E+04    0.59171E+04   -0.11724E+05 26364   0.134E+03
DAV:   2     0.456132021614E+04   -0.13558E+04   -0.12961E+04 30246   0.313E+02
DAV:   3     0.447213898244E+04   -0.89181E+02   -0.85008E+02 31280   0.698E+01
DAV:   4     0.446992626275E+04   -0.22127E+01   -0.21628E+01 30304   0.856E+00
DAV:   5     0.446987945675E+04   -0.46806E-01   -0.46567E-01 30520   0.935E-01    0.299E+02
DAV:   6     0.831960500281E+04    0.38497E+04   -0.54459E+03 43808   0.155E+02    0.126E+02
DAV:   7     0.913886394357E+04    0.81926E+03   -0.12232E+03 32128   0.120E+02    0.663E+01
DAV:   8     0.951606224175E+04    0.37720E+03   -0.26142E+02 31080   0.682E+01    0.308E+01
DAV:   9     0.959435782780E+04    0.78296E+02   -0.34195E+01 36088   0.337E+01    0.140E+01
DAV:  10     0.962583292292E+04    0.31475E+02   -0.31837E+01 31384   0.285E+01    0.813E+00
DAV:  11     0.963193713361E+04    0.61042E+01   -0.77659E+00 38120   0.171E+01    0.446E+00
DAV:  12     0.963624301500E+04    0.43059E+01   -0.87734E+00 30944   0.121E+01    0.435E+00
DAV:  13     0.963436372480E+04   -0.18793E+01   -0.19741E+01 29895   0.194E+01    0.310E+00
DAV:  14     0.961514261262E+04   -0.19221E+02   -0.93920E+01 29038   0.241E+01    0.636E+00
DAV:  15     0.954446017244E+04   -0.70682E+02   -0.29425E+02 29072   0.419E+01    0.112E+01
DAV:  16     0.947334173290E+04   -0.71118E+02   -0.18314E+02 30664   0.343E+01    0.981E+00
DAV:  17     0.947323738754E+04   -0.10435E+00   -0.20327E+01 30112   0.153E+01    0.324E+00
DAV:  18     0.947255733920E+04   -0.68005E+00   -0.18232E+00 32400   0.567E+00    0.378E+00
DAV:  19     0.947235424380E+04   -0.20310E+00   -0.26330E-01 35088   0.354E+00    0.366E+00
DAV:  20     0.947110241800E+04   -0.12518E+01   -0.10856E+00 29816   0.521E+00    0.450E+00
DAV:  21     0.947009546833E+04   -0.10069E+01   -0.26209E-01 29360   0.206E+00    0.519E+00
DAV:  22     0.946958283704E+04   -0.51263E+00   -0.92468E-02 30240   0.114E+00    0.557E+00
DAV:  23     0.947039563057E+04    0.81279E+00   -0.12062E-01 28376   0.111E+00    0.502E+00
DAV:  24     0.947326290175E+04    0.28673E+01   -0.28782E+00 28115   0.522E+00    0.218E+00
DAV:  25     0.947387386324E+04    0.61096E+00   -0.18576E+00 29431   0.446E+00    0.415E-01
DAV:  26     0.947387643359E+04    0.25704E-02   -0.84032E-02 30872   0.118E+00    0.146E-01
DAV:  27     0.947387166936E+04   -0.47642E-02   -0.10699E-02 29872   0.362E-01    0.222E-01
DAV:  28     0.947387695602E+04    0.52867E-02   -0.60884E-03 28400   0.239E-01    0.107E-01
DAV:  29     0.947387838224E+04    0.14262E-02   -0.47094E-03 28952   0.243E-01    0.197E-02
DAV:  30     0.947387828730E+04   -0.94942E-04   -0.94882E-04 28144   0.999E-02
   1 F= 0.94738783E+04 E0= 0.94739124E+04  d E =0.947388E+04  mag=     0.0000
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
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1楼 2010-04-08 10:02:28
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
顶一下嘿嘿
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2楼2010-04-08 10:32:02
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nbaliver

木虫 (初入文坛)
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢！ 2010-04-09 09:31
总能怎么是正值？ 你的两个原子距离过近或者重合了吗？没给出POSCAR没法判断阿
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3楼2010-04-08 12:18:53
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟

POSCAR

引用回帖:
Originally posted by nbaliver at 2010-04-08 12:18:53:
总能怎么是正值？ 你的两个原子距离过近或者重合了吗？没给出POSCAR没法判断阿

Direct
0.2524999976158143          0.2524999976158140    0.5034999847412111
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0.9135000109672559   0.9135000109672552    0.1999000012874596
-0.2524999976158141  -0.2524999976158142   -0.5034999847412111
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-0.9135000109672553  -0.9135000109672558   -0.1999000012874596
0.1723800152540210   0.6523400098085405    0.6912800073623655
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-0.000000000000000   0.5000000000000000    -0.0000000000000000
-0.500000000000000   0.0000000000000000    0.0000000000000000
0.1327000111341479   0.5011000186204909    0.7534000277519224
0.1467709988355637   0.3532290011644364    0.9061329960823060
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-0.3532290011644365  -0.1467709988355637   -0.9061329960823061
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4楼2010-04-08 12:45:55
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
大伙说说撒
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5楼2010-04-08 15:33:57
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hn19870519

木虫 (正式写手)
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢参与！ 2010-04-09 09:31
这个问题还真没遇到过
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6楼2010-04-08 15:52:15
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hn19870519

木虫 (正式写手)
calos818(金币+1): 2010-04-08 16:23
不过也说不定是集群的问题。。。我以前遇到过没算完就停的，也很纠结，后来发现是集群的问题。楼主再仔细检查一下吧
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7楼2010-04-08 15:53:43
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
Originally posted by hn19870519 at 2010-04-08 15:53:43:
不过也说不定是集群的问题。。。我以前遇到过没算完就停的，也很纠结，后来发现是集群的问题。楼主再仔细检查一下吧

集群哪里出问题的，说来听听呵呵
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8楼2010-04-08 16:23:49
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hn19870519

木虫 (正式写手)
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢参与！ 2010-04-09 09:32
引用回帖:
Originally posted by calos818 at 2010-04-08 16:23:49:

集群哪里出问题的，说来听听呵呵

。。。这个很纠结啊，我遇到的情况是投一个任务到集群上，然后算了几个小时，也没提示错误什么的就自己停了。其他的我真的不清楚啊。。。楼主的金币白给我了。。。
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9楼2010-04-08 22:18:56
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
Originally posted by hn19870519 at 2010-04-08 22:18:56:

。。。这个很纠结啊，我遇到的情况是投一个任务到集群上，然后算了几个小时，也没提示错误什么的就自己停了。其他的我真的不清楚啊。。。楼主的金币白给我了。。。

汗……这个金币本来就是虚拟的，大家互相帮助吧，谢谢你！
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10楼2010-04-09 09:07:41
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