24小时热门版块排行榜    

查看: 15586  |  回复: 314

cuicui2397

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
前辈你好,由于要学习第一性原理,之前一直在学习ms这个软件,现在要安装vasp软件,由于对linux不熟悉,身边又没有能帮上忙的,所以对于vasp安装很是头疼,查了很多安装教程,由于系统版本不同以及所选用的库,软件不同,搞了快两周了,也没搞定,求帮助啊!我用的是ubuntu11.10系统,l_fcompxe_2013.1.117.tgz,mpich2,vasp5.2,由于电脑上还安装有lammps软件,所以已经安装了mpich2和fftw。求帮助啊!谢谢!
251楼2013-09-20 11:25:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

引用回帖:
251楼: Originally posted by cuicui2397 at 2013-09-20 11:25:37
前辈你好,由于要学习第一性原理,之前一直在学习ms这个软件,现在要安装vasp软件,由于对linux不熟悉,身边又没有能帮上忙的,所以对于vasp安装很是头疼,查了很多安装教程,由于系统版本不同以及所选用的库,软件 ...

你得说说问题,是什么?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

真理是一点点接近的!
252楼2013-09-21 00:41:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuicui2397

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
引用回帖:
252楼: Originally posted by gavinliu7390 at 2013-09-21 00:41:25
你得说说问题,是什么?...

呵呵,我自己都装的稀里糊涂的,我记得安装intel的l_fcompxe_2013.1.117.tgz(内含编译器和数学库)时,提示有什么问题没解决,我也没管,直接默认的路径,提示安装done,由于师兄之前装有mpich2,我就没装,我就开始装vasp,在改makefile文件时,也改得稀里糊涂的,make不过去。求帮忙啊!自己真是菜鸟一枚,望详细指导一下。
253楼2013-09-21 09:32:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阳光的影子

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,我想问一下文献中All these parameters ensure the numerical errors in the calculated defect formation
energies less than 20 meV这句话的是指EDIFF设置等于20mev,可我设置成EDIFF=1E-04ev,这个对我的结果影响大吗?
254楼2013-10-31 15:37:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阳光的影子

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
比较不同体系的形成能,选择一个最稳定的构型时,有一个算不出来,我能不能改变某它的一些参数,这样会影响比较的结果吗?EDIFF参数值改变的话会影响结果吗?
255楼2013-10-31 15:41:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

引用回帖:
255楼: Originally posted by 阳光的影子 at 2013-10-31 15:41:11
比较不同体系的形成能,选择一个最稳定的构型时,有一个算不出来,我能不能改变某它的一些参数,这样会影响比较的结果吗?EDIFF参数值改变的话会影响结果吗?

一般影响不大。
真理是一点点接近的!
256楼2013-11-03 09:44:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

csuliutao

银虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,VASP用的时候,如何写代码,而且写的时候有什么特别要注意的
257楼2013-11-09 08:50:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

引用回帖:
257楼: Originally posted by csuliutao at 2013-11-09 08:50:33
楼主,VASP用的时候,如何写代码,而且写的时候有什么特别要注意的

不明白。
真理是一点点接近的!
258楼2013-11-09 10:51:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

csuliutao

银虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
请问下楼主,在进行结构优化时,得到错误说明,不正确的结尾怎么解决,如下

#!/bin/sh
#PBS -N Si
#PBS -q csupublic
#PBS -l nodes=1:ppn=4
# Change into the working directory
cd $PBS_O_WORKDIR
# Calculate the number of processors
NP=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
date > output
echo $PBS_O_WORKDIR >>output
echo ${NP} >>output
cat ${PBS_NODEFILE} >>output
vasp_exe=/public/software/qchem/vasp/vasp4.6.35-ompi-amd64
MPIUSE="mpirun -np $NP -machinefile $PBS_NODEFILE --mca btl self,openib,sm -bind-to-core ${vasp_exe}"


for i in 3.5 3.6 3.7 3.8 3.9 4.0 4.1 4.2 4.3;do
cat>POSCAR<<!
fcc:
    $i
0.5 0.5 0.0
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
  1
cartesian
0 0 0


echo "a=$i";$bin
E='tail -1 OSZICAR';echo $i $E>>SUMMARY.fcc
done
cat SUMMARY.fcc
259楼2013-12-19 14:17:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

倔强的小蚊虫

铜虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
对金属Tiω相单质HCP点阵常数,a和c进行优化时,遇到了问题,几天都没有得到解决。现在把问题分解为两个具体问题,第一个问题:输入文件关键词需要做什么不一样的设置?第二问题:脚本文件怎么写,我写的是否正确?希望楼主提供指导
【其他】在线答疑:VASP的问题
1.jpg


【其他】在线答疑:VASP的问题-1
2.jpg

自制力,创造力,行动力,三力超群,才能卓越。
260楼2014-02-26 19:06:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 gavinliu7390 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见