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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

[交流] 【其他】在线答疑:VASP的问题 已有104人参与

vasp是一个很不错的软件,尤其称道的是他的计算速度和稳定性。
由于wuchenwf版主即将隐退,特开此贴。
本人能力也极其有限,所以在此抛砖引玉,标题虽是答疑,但是我觉得更应该是讨论。大家术业有专攻,VASP的每个方面不可能都掌握。希望和大家也共同进步。

老帖地址(供大家参考)(wuchenwf):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1740019&fpage=1

老帖地址(供大家参考)(九尾鱼):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=679096&fpage=1

老帖地址(供大家参考)(wuchenwf):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1083523
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-08-13 10:01:46:


对,是em64t里面的文件libmkl_intel_lp64.so等等
你需要指定这些库的链接

我把blas改成这样了
BLAS= -Wl,--start-group /opt/intel/Compiler/11.1/072/mkl/lib/32/libmkl_intel.a  /opt/intel/Compiler/11.1/072/mkl/lib/32/libmkl_intel_thread.a  /opt/intel/Compiler/11.1/072/mkl/lib/32/libmkl_core.a  -Wl,--end-group  -lguide -lpthread
运行后得到
lattice.o  poscar.o   ini.o       xclib.o     xclib_grad.o radial.o   pseudo.o   mgrid.o    gridq.o     ebs.o mkpoints.o wave.o     wave_mpi.o  wave_high.o symmetry.o symlib.o   lattlib.o  random.o      nonl.o     nonlr.o    nonl_high.o dfast.o    choleski2.o mix.o      hamil.o    xcgrad.o   xcspin.o    potex1.o   potex2.o constrmag.o cl_shift.o relativistic.o LDApU.o paw_base.o metagga.o  egrad.o    pawsym.o   pawfock.o  pawlhf.o    rhfatm.o  paw.o mkpoints_full.o       charge.o   dipol.o    pot.o dos.o      elf.o      tet.o      tetweight.o hamil_rot.o steep.o    chain.o    dyna.o     sphpro.o    us.o  core_rel.o aedens.o   wavpre.o   wavpre_noio.o broyden.o dynbr.o    rmm-diis.o reader.o   writer.o   tutor.o xml_writer.o brent.o    stufak.o   fileio.o   opergrid.o stepver.o chgloc.o   fast_aug.o fock.o     mkpoints_change.o sym_grad.o mymath.o   internals.o dimer_heyden.o dvvtrajectory.o vdwforcefield.o hamil_high.o nmr.o    force.o pead.o     subrot.o   subrot_scf.o pwlhf.o  gw_model.o optreal.o   davidson.o electron.o rot.o  electron_all.o shm.o    pardens.o  paircorrection.o optics.o   constr_cell_relax.o   stm.o    finite_diff.o elpol.o hamil_lr.o rmm-diis_lr.o  subrot_cluster.o subrot_lr.o lr_helper.o hamil_lrf.o   elinear_response.o ilinear_response.o linear_optics.o linear_response.o setlocalpp.o  wannier.o electron_OEP.o electron_lhf.o twoelectron4o.o ratpol.o screened_2e.o wave_cacher.o chi_base.o wpot.o local_field.o ump2.o bse.o acfdt.o chi.o sydmat.o    fft3dfurth.o fft3dlib.o -L../vasp.5.lib -ldmy ../vasp.5.lib/linpack_double.o ../vasp.5.lib/lapack_double.o -Wl,--start-group /opt/intel/Compiler/11.1/072/mkl/lib/32/libmkl_intel.a  /opt/intel/Compiler/11.1/072/mkl/lib/32/libmkl_intel_thread.a  /opt/intel/Compiler/11.1/072/mkl/lib/32/libmkl_core.a  -Wl,--end-group  -lguide -lpthread
heyi@heyi-laptop:~/vasp/vasp.5.2$
没有提示出错,那是不是说明这一步可以了?
嘟啦啦嘟啦啦嘟
72楼2010-08-13 11:25:47
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lishufei

金虫 (正式写手)

vasp安装


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
问一下前辈
今天我把vasp4.6安装成功啦。
但我在输入命令vasp时不能运算。
说是找不到这个命令。
怎样改一下啊。
我su后口令
vasp它还说找不到命令。
怎么办啊   我明明安装是成功的啊



好像以前师兄把root 改成bin
怎么改? 谢谢前辈啊
2楼2010-04-13 21:12:08
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lishufei

金虫 (正式写手)

★ ★
xiaohunhun(金币+2):xiexie 2010-04-13 22:53
gavinliu7390:你的编译过程应该没问题。 2010-04-14 07:41
说明一下我安装的是串行的安装方法如下:
vasp4.6 安装全部过程
串行所需文件
l_fc_c_9.1.036.tar     l_mkl_p_9.1.023.tar    makefile 串行    NCOM_L_MKL__NP5T-TXVGVMK8.lic     vasp.4.6.tar.gz       vasp.4.lib.tar.gz
NCOM_L_CMP_FOR_NC5M-MNS7LCG3.lic
1. 解压l_mkl_p_9.1.023.tar
    命令 tar  -xvf  l_mkl_p_9.1.023.tar
     进入l_mkl_p_9.1.023   命令cd l_mkl_p_9.1.023
     安装 ./install.sh
     以后按照安装说明进行。
2  解压 l_fc_c_9.1.036.tar
    命令  tar  -xvf l_fc_c_9.1.036.tar
     进入l_fc_c_9.1.036 命令 cd  l_fc_c_9.1.036.tar
     安装 ./install.sh
     以后按照安装说明进行。
注意所有安装都在root下 进入安装说明里会有提示。
3   改变量环境
    退出后 进入根目录su 口令
     新目录要cd 再回车 显示~
     输入 vi .bashrc  回车
     进入后改成   
      # .bashrc

      # User specific aliases and functions

        alias rm='rm -i'
        alias cp='cp -i'
        alias mv='mv -i'
        PATH="$PATH:/usr/local/bin"  (该部分为mpich2的路径)注意安装并行才用
        # Source global definitions
         if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc

       fi   (以下为mkl及fortran安装后需设置的环境变量)
         export  LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/mkl/9.1.023/lib/em64t:/opt/intel/fce/9.1.036/lib
. /opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh
export  LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh:$LD_LIBRARY_PATH
注意进入后按i才能对内容修改。
改好后按esc键 :wq 这是保存并退出。
保存后在终端执行命令source /root/.bashrc就可以了
执行没错即可。
4  进入放文件的目录 cd  
  解压vasp.4.6.tar.gz    和   vasp.4.lib.tar.gz
   tar xzvf vasp.4.6.tar.gz  和tar xzvf vasp.4.lib.tar.gz
进入vasp.4.lib目录 cd vasp.4.lib
cp makefile.linux_ifc_P4  makefile
打开makefile文件修改FC=ifort 保存文件
make
编译成功后,得到libdmy.a文件。
5  退出vasp.4.lib目录 进入vasp.4.6目录
  把上面的makefile拷贝到vasp.4.6里去。(这里面是修改过的不需要改动)
进行make
运行结束安装成功。如果显示某行错误可在打开makefile文件找到那行,如果前面没有#就加上#,如果有#就去掉#。在进行make。
3楼2010-04-13 21:14:24
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+5):谢谢解答 2010-04-15 08:38
引用回帖:
Originally posted by lishufei at 2010-04-13 21:12:08:
问一下前辈
今天我把vasp4.6安装成功啦。
但我在输入命令vasp时不能运算。
说是找不到这个命令。
怎样改一下啊。
我su后口令
vasp它还说找不到命令。
怎么办啊   我明明安装是成功的啊



好像以前师兄 ...

如果你的vasp已经编译成功,找不到命令。一般解决办法有三种。由于编译好后会生成一个vasp文件。
一,你可以将这个vasp文件考到~/bin目录下。然后在系统的任何位置都可以执行vasp.
二,如果上面的方法不可以,你就考到/usr/local/bin 目录下,不过这个需要超级用户密码。
三,例如你编译成功的目录是~/software/vasp/,你在任何位置执行的时候可以直接执行~/software/vasp/vasp, 也可以。
真理是一点点接近的!
4楼2010-04-14 07:39:56
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