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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

[交流] 【其他】在线答疑:VASP的问题 已有104人参与

vasp是一个很不错的软件,尤其称道的是他的计算速度和稳定性。
由于wuchenwf版主即将隐退,特开此贴。
本人能力也极其有限,所以在此抛砖引玉,标题虽是答疑,但是我觉得更应该是讨论。大家术业有专攻,VASP的每个方面不可能都掌握。希望和大家也共同进步。

老帖地址(供大家参考)(wuchenwf):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1740019&fpage=1

老帖地址(供大家参考)(九尾鱼):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=679096&fpage=1

老帖地址(供大家参考)(wuchenwf):http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1083523
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shelay

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5): 给个红包,谢谢回帖
请问,我优化完TiN结构后,应力为:
Total      -0.00575    -0.00575    -0.00575     0.00000     0.00000     0.00000
  in kB      -0.11958    -0.11958    -0.11958     0.00000     0.00000     0.00000
  external pressure =       -0.12 kB  Pullay stress =        0.00 kB
(INCAR
SYSTEM = TiN
ENCUT = 450
ISTART = 0; ICHARG = 2
ISMEAR = 1;SIGMA = 0.2
NSW = 60; IBRION = 1
ISIF = 3
POTIM = 0.05
EDIFF = 1E-6; EDIFFG = -1E-5
PREC = Accurate)

然后用优化后的结构计算能量的时候应力变为如下:
  Total       0.06807     0.06807     0.06807     0.00000     0.00000     0.00000
  in kB       1.41457     1.41457     1.41457     0.00000     0.00000     0.00000
  external pressure =        1.41 kB  Pullay stress =        0.00 kB
(INCAR
SYSTEM = TiN
ENCUT = 450
ISTART = 0; ICHARG = 2
ISMEAR = 1
PREC = Accurate)
请问是怎么回事阿?我优化的时候不是把应力都优化的很小了吗?为什么直接用优化完的结构计算能量却得到更大的应力,是不是算法有问题阿?还是其它原因阿,清大家赐教!
211楼2012-03-14 21:40:20
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lishufei

金虫 (正式写手)

vasp安装


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
问一下前辈
今天我把vasp4.6安装成功啦。
但我在输入命令vasp时不能运算。
说是找不到这个命令。
怎样改一下啊。
我su后口令
vasp它还说找不到命令。
怎么办啊   我明明安装是成功的啊



好像以前师兄把root 改成bin
怎么改? 谢谢前辈啊
2楼2010-04-13 21:12:08
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lishufei

金虫 (正式写手)

★ ★
xiaohunhun(金币+2):xiexie 2010-04-13 22:53
gavinliu7390:你的编译过程应该没问题。 2010-04-14 07:41
说明一下我安装的是串行的安装方法如下:
vasp4.6 安装全部过程
串行所需文件
l_fc_c_9.1.036.tar     l_mkl_p_9.1.023.tar    makefile 串行    NCOM_L_MKL__NP5T-TXVGVMK8.lic     vasp.4.6.tar.gz       vasp.4.lib.tar.gz
NCOM_L_CMP_FOR_NC5M-MNS7LCG3.lic
1. 解压l_mkl_p_9.1.023.tar
    命令 tar  -xvf  l_mkl_p_9.1.023.tar
     进入l_mkl_p_9.1.023   命令cd l_mkl_p_9.1.023
     安装 ./install.sh
     以后按照安装说明进行。
2  解压 l_fc_c_9.1.036.tar
    命令  tar  -xvf l_fc_c_9.1.036.tar
     进入l_fc_c_9.1.036 命令 cd  l_fc_c_9.1.036.tar
     安装 ./install.sh
     以后按照安装说明进行。
注意所有安装都在root下 进入安装说明里会有提示。
3   改变量环境
    退出后 进入根目录su 口令
     新目录要cd 再回车 显示~
     输入 vi .bashrc  回车
     进入后改成   
      # .bashrc

      # User specific aliases and functions

        alias rm='rm -i'
        alias cp='cp -i'
        alias mv='mv -i'
        PATH="$PATH:/usr/local/bin"  (该部分为mpich2的路径)注意安装并行才用
        # Source global definitions
         if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc

       fi   (以下为mkl及fortran安装后需设置的环境变量)
         export  LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/mkl/9.1.023/lib/em64t:/opt/intel/fce/9.1.036/lib
. /opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh
export  LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh:$LD_LIBRARY_PATH
注意进入后按i才能对内容修改。
改好后按esc键 :wq 这是保存并退出。
保存后在终端执行命令source /root/.bashrc就可以了
执行没错即可。
4  进入放文件的目录 cd  
  解压vasp.4.6.tar.gz    和   vasp.4.lib.tar.gz
   tar xzvf vasp.4.6.tar.gz  和tar xzvf vasp.4.lib.tar.gz
进入vasp.4.lib目录 cd vasp.4.lib
cp makefile.linux_ifc_P4  makefile
打开makefile文件修改FC=ifort 保存文件
make
编译成功后,得到libdmy.a文件。
5  退出vasp.4.lib目录 进入vasp.4.6目录
  把上面的makefile拷贝到vasp.4.6里去。(这里面是修改过的不需要改动)
进行make
运行结束安装成功。如果显示某行错误可在打开makefile文件找到那行,如果前面没有#就加上#,如果有#就去掉#。在进行make。
3楼2010-04-13 21:14:24
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

★ ★ ★ ★ ★
aylayl08(金币+5):谢谢解答 2010-04-15 08:38
引用回帖:
Originally posted by lishufei at 2010-04-13 21:12:08:
问一下前辈
今天我把vasp4.6安装成功啦。
但我在输入命令vasp时不能运算。
说是找不到这个命令。
怎样改一下啊。
我su后口令
vasp它还说找不到命令。
怎么办啊   我明明安装是成功的啊



好像以前师兄 ...

如果你的vasp已经编译成功,找不到命令。一般解决办法有三种。由于编译好后会生成一个vasp文件。
一,你可以将这个vasp文件考到~/bin目录下。然后在系统的任何位置都可以执行vasp.
二,如果上面的方法不可以,你就考到/usr/local/bin 目录下,不过这个需要超级用户密码。
三,例如你编译成功的目录是~/software/vasp/,你在任何位置执行的时候可以直接执行~/software/vasp/vasp, 也可以。
真理是一点点接近的!
4楼2010-04-14 07:39:56
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