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gavinliu7390木虫 (著名写手)
叶落鹰飞
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[交流]
【其他】在线答疑:VASP的问题 已有104人参与
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vasp是一个很不错的软件，尤其称道的是他的计算速度和稳定性。 由于wuchenwf版主即将隐退，特开此贴。 本人能力也极其有限，所以在此抛砖引玉，标题虽是答疑，但是我觉得更应该是讨论。大家术业有专攻，VASP的每个方面不可能都掌握。希望和大家也共同进步。 老帖地址（供大家参考）（wuchenwf）：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1740019&fpage=1 老帖地址（供大家参考）（九尾鱼）：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=679096&fpage=1 老帖地址（供大家参考）（wuchenwf）：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1083523 |
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xiaowu787
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
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求教： 在用Material Studio构建界面模型的过程中，有几点疑惑：1. 由于晶体的晶格常数不同，界面出现错配即有一定的错配度。由于错配度，建立模型不容易保持模型的周期性结构。2. Material Studio的build layer构建两种晶体界面时，将两种晶体沿平行界面的基矢分别变化组成界面结构并保持整个模型的周期性结构。在构建界面时，两部分晶体的基矢变形而不再是平衡结构的晶格常数，这种情况感觉和实际情况有些不符。在优化结构的过程中，处于表面或界面的原子可以沿三维方向弛豫，作为块体性质的这部分原子怎么弛豫呢？那些原子由于组合界面也稍微偏离平衡位置。3. 体系内的原子全部优化是否更符合实际情况。如果整个体系全部优化，估计收敛会是很大问题？作为块体部分的原子是否会优化到理想的位置？周期性又是否能保持？用VASP的Selective Dynamics,原子该怎么选择呢？ |
201楼2011-12-23 23:07:21
lishufei
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2楼2010-04-13 21:12:08
lishufei
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xiaohunhun(金币+2):xiexie 2010-04-13 22:53
gavinliu7390:你的编译过程应该没问题。 2010-04-14 07:41
xiaohunhun(金币+2):xiexie 2010-04-13 22:53
gavinliu7390:你的编译过程应该没问题。 2010-04-14 07:41
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说明一下我安装的是串行的安装方法如下： vasp4.6 安装全部过程 串行所需文件 l_fc_c_9.1.036.tar l_mkl_p_9.1.023.tar makefile 串行 NCOM_L_MKL__NP5T-TXVGVMK8.lic vasp.4.6.tar.gz vasp.4.lib.tar.gz NCOM_L_CMP_FOR_NC5M-MNS7LCG3.lic 1. 解压l_mkl_p_9.1.023.tar 命令 tar -xvf l_mkl_p_9.1.023.tar 进入l_mkl_p_9.1.023 命令cd l_mkl_p_9.1.023 安装 ./install.sh 以后按照安装说明进行。 2 解压 l_fc_c_9.1.036.tar 命令 tar -xvf l_fc_c_9.1.036.tar 进入l_fc_c_9.1.036 命令 cd l_fc_c_9.1.036.tar 安装 ./install.sh 以后按照安装说明进行。 注意所有安装都在root下 进入安装说明里会有提示。 3 改变量环境 退出后 进入根目录su 口令 新目录要cd 再回车 显示~ 输入 vi .bashrc 回车 进入后改成 # .bashrc # User specific aliases and functions alias rm='rm -i' alias cp='cp -i' alias mv='mv -i' PATH="$PATH:/usr/local/bin" (该部分为mpich2的路径）注意安装并行才用 # Source global definitions if [ -f /etc/bashrc ]; then . /etc/bashrc fi （以下为mkl及fortran安装后需设置的环境变量） export LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/mkl/9.1.023/lib/em64t:/opt/intel/fce/9.1.036/lib . /opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh export LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/fce/9.1.036/bin/ifortvars.sh:$LD_LIBRARY_PATH 注意进入后按i才能对内容修改。 改好后按esc键 ：wq 这是保存并退出。 保存后在终端执行命令source /root/.bashrc就可以了 执行没错即可。 4 进入放文件的目录 cd 解压vasp.4.6.tar.gz 和 vasp.4.lib.tar.gz tar xzvf vasp.4.6.tar.gz 和tar xzvf vasp.4.lib.tar.gz 进入vasp.4.lib目录 cd vasp.4.lib cp makefile.linux_ifc_P4 makefile 打开makefile文件修改FC=ifort 保存文件 make 编译成功后，得到libdmy.a文件。 5 退出vasp.4.lib目录 进入vasp.4.6目录 把上面的makefile拷贝到vasp.4.6里去。（这里面是修改过的不需要改动） 进行make 运行结束安装成功。如果显示某行错误可在打开makefile文件找到那行，如果前面没有#就加上#，如果有#就去掉#。在进行make。 |
3楼2010-04-13 21:14:24
gavinliu7390
木虫 (著名写手)
叶落鹰飞
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4楼2010-04-14 07:39:56
